- BH11.11/セマンティックゲノムアノテーションデータベースの試作
## UniProtとCyanoBaseから抽出したstanza確認 -11/21
* UniProtとCyanoBaseから抽出したstanza確認 - 事前調査済 -ktym, so [[ファイル:JS
17キロバイト(1,707単語) - 2013年8月21日 (水) 10:32
- BH11.11/セマンティックゲノムアノテーションデータベースの試作/CyanoBase
<http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/NIES39> rdf:type kazusa:DSN .
<http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/NIES39> rdfs:label "Arthrospira platensis NIES-39" .
5キロバイト(695単語) - 2013年8月21日 (水) 10:32
- BH12.12/SPARQLthon/SPARQLendpoints
*** CyanoBase ID (NCBI Gene IDへのリンク) <http://dbcls.rois.ac.jp/lsdb/>
4キロバイト(503単語) - 2012年12月19日 (水) 06:37
- BH12.12/SPARQLthon/TogoAnnotation
<http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/Synechocystis> 2394 "Synechocystis"
<http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/Anabaena> 905 "Anabaena"
15キロバイト(1,829単語) - 2013年8月21日 (水) 10:29
- BH12.12/SPARQLthon5/TogoAnnotation
** CyanoBase, RhizoBaseのドメイン変更に伴いDB内のブックマークURLデー
== CyanoBase拡張==
4キロバイト(454単語) - 2013年8月21日 (水) 10:29
- BH12.12/SPARQLthon8/INSDCオントロジー
ruby refseq2ttl.rb genome_conf/datasets/cyanobase/data_sources/Synechocystis/genbank/NC_000911.gb
7キロバイト(999単語) - 2013年8月21日 (水) 10:41
- BH12.12/SPARQLthon8/TogoStanza
TogoGenome, MicrobeDB.jp, CyanoBase などで必要なスタンザをリストアップし、これから実装
20キロバイト(2,171単語) - 2013年8月21日 (水) 10:45
- SPARQLthon17/CrossSearch
== CyanoBaseでのマークアップ(例) ==
...op="url" href="http://genome.microbedb.jp/cyanobase"><span itemprop="name">CyanoBase</span></a>
7キロバイト(658単語) - 2014年2月25日 (火) 07:42
- SPARQLthon26/TogoGenome
* [[SPARQLthon26/CyanoBase]]
18キロバイト(1,796単語) - 2014年12月24日 (水) 02:26
- SPARQLthon27
* CyanoBase: 約 6 個くらい?
11キロバイト(353単語) - 2015年4月2日 (木) 02:09
- SPARQLthon26/CyanoBase
== CyanoBase ==
4キロバイト(431単語) - 2016年12月13日 (火) 01:47
- SPARQLthon26/GenomeDataSubset
* CyanoBaseの更新系にも利用
#values ?taxon_root {tax:1117} #For CyanoBase
6キロバイト(619単語) - 2014年12月17日 (水) 08:38
- SPARQLthon28
*** MicrobeDB.jp/CyanoBase で開発されているスタンザのカテゴリもオントロジーで
9キロバイト(354単語) - 2015年1月18日 (日) 10:56
- BH16.12/GGGenome CyanoBase
== CyanoBaseの情報提供 ==
* メタデータ: [http://genome.microbedb.jp/cyanobase CyanoBase]の376ゲノムリストはTogoStanzaを利用して提供されており
2キロバイト(111単語) - 2016年12月15日 (木) 09:13
- BH16.12/FALDO
=== CyanoBase ===
FROM <http://genome.microbedb.jp/resources/cyanobase/genbank>
4キロバイト(441単語) - 2016年12月16日 (金) 01:50
- SPARQLthon55
* GGGenome-CyanoBase メタデータ作成(藤澤)
** CyanoBase 6個 http://genome.microbedb.jp/stanza
5キロバイト(231単語) - 2017年6月27日 (火) 10:02
- MicrobeDB.jpポータル開発
* (参考)CyanoBaseの例 https://cyanobase.github.io/document/#about-cyanobase
23キロバイト(1,566単語) - 2020年2月21日 (金) 08:37