SPARQLthon84

提供：TogoWiki

第84回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次 1 開催概要 2 プロジェクト 2.1 TPP グループ全体 2.1.1 継続中 2.1.2 終了 2.2 SPARQLthon グループ 2.3 今後の予定 3 参考リンク 4 参加者

開催概要

• 開催期間：2019年 9月 26（木）- 27日（金）
• 開催場所：ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) @ 東京大学 柏の葉キャンパス駅前 サテライト 6階
• アクセス：http://dbcls.rois.ac.jp/access
• 開催連絡：http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて
• 周辺の食事処 Google Map

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

• データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
  • Human Microbiome Associated Disease Ontology (HMADO) ver. 0.1のClass（約300 Class)、階層構造等 (3階層) を考えた（森、岡別府）
    • BioPortalのNameSpace取得、purl.jpのDomain名申請を行った（森）
  • 検索用ESインデックスJSON設計、Taxonomy, MEOについてRDF→JSON-LD→JSON（藤澤）
• 糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
• 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
• 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
• 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
• エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
• ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
• 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
• プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/
  • サイトマイナー改修（田中、守屋、五斗）
    • 同時に呼ぶと同じStanzaが埋まらない
    • タイミングをずらすと埋まる

終了

• 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
• 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
• 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
• プロテオーム統合データベース：jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
• 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)

SPARQLthon グループ

• RDF config的なの生成（守屋）
• 第4回RDF講習会 のページを作り、講習内容を検討した (片山・川島・岡別府)
• LODチャレンジ2019 に応募した (片山・川島・守屋・永野)
• http://sparql.med2rdf.org に Med2RDF のデータセットをロードした (片山)

今後の予定

参考リンク

• これまでの SPARQLthon

参加者

• 片山俊明 (DBCLS)
• 川島秀一 (DBCLS)
• 岡別府陽子 (OKBP) 26日午後から
• 小野浩雅 (DBCLS)
• 仲里猛留 (DBCLS)
• 内藤雄樹 (DBCLS)
• 池田秀也 (DBCLS)
• 大田達郎 (DBCLS)
• 山本謙太郎(togofarm)
• 高月照江 (DBCLS)26日のみ
• 守屋勇樹 (DBCLS)
• 建石由佳（NBDC）26日のみ
• 永野朗夫（PENQE)
• 平原麗夏（PENQE) 26日のみ
• 浅野由衣（PENQE)
• 平木愛子 (DBCLS)
• 森宙史（遺伝研）26日は午後から
• 千葉啓和（DBCLS）
• 福島敦史 (RIKEN)26日午後のみ
• 高橋みき子 (RIKEN)26日午後のみ
• 鐘ケ江弘美（NARO）26日のみ
• 平川英樹（かずさ）26日午後のみ
• 桂樹哲雄（NARO）26日のみ
• 畠中秀樹 (DBCLS)
• 藤澤貴智（遺伝研）