SPARQLthon84
提供:TogoWiki
第84回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。
目次 |
開催概要
- 開催期間:2019年 9月 26(木)- 27日(金)
- 開催場所:ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) @ 東京大学 柏の葉キャンパス駅前 サテライト 6階
- アクセス:http://dbcls.rois.ac.jp/access
- 開催連絡:http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて
- 周辺の食事処 Google Map
プロジェクト
TPP グループ全体
継続中
- データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
- Human Microbiome Associated Disease Ontology (HMADO) ver. 0.1のClass(約300 Class)、階層構造等 (3階層) を考えた(森、岡別府)
- BioPortalのNameSpace取得、purl.jpのDomain名申請を行った(森)
- 検索用ESインデックスJSON設計、Taxonomy, MEOについてRDF→JSON-LD→JSON(藤澤)
- Human Microbiome Associated Disease Ontology (HMADO) ver. 0.1のClass(約300 Class)、階層構造等 (3階層) を考えた(森、岡別府)
- 糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
- 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
- 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
- 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
- エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
- ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
- 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
- プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化(石濱)- https://jpostdb.org/
- サイトマイナー改修(田中、守屋、五斗)
終了
- 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
- 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
- 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
- プロテオーム統合データベース:jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
- 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)
SPARQLthon グループ
- RDF config的なの生成(守屋)
- 第4回RDF講習会 のページを作り、講習内容を検討した (片山・川島・岡別府)
- LODチャレンジ2019 に応募した (片山・川島・守屋・永野)
- http://sparql.med2rdf.org に Med2RDF のデータセットをロードした (片山)
今後の予定
参考リンク
- これまでの SPARQLthon
参加者
- 片山俊明 (DBCLS)
- 川島秀一 (DBCLS)
- 岡別府陽子 (OKBP) 26日午後から
- 小野浩雅 (DBCLS)
- 仲里猛留 (DBCLS)
- 内藤雄樹 (DBCLS)
- 池田秀也 (DBCLS)
- 大田達郎 (DBCLS)
- 山本謙太郎(togofarm)
- 高月照江 (DBCLS)26日のみ
- 守屋勇樹 (DBCLS)
- 建石由佳(NBDC)26日のみ
- 永野朗夫(PENQE)
- 平原麗夏(PENQE) 26日のみ
- 浅野由衣(PENQE)
- 平木愛子 (DBCLS)
- 森宙史(遺伝研)26日は午後から
- 千葉啓和(DBCLS)
- 福島敦史 (RIKEN)26日午後のみ
- 高橋みき子 (RIKEN)26日午後のみ
- 鐘ケ江弘美(NARO)26日のみ
- 平川英樹(かずさ)26日午後のみ
- 桂樹哲雄(NARO)26日のみ
- 畠中秀樹 (DBCLS)
- 藤澤貴智(遺伝研)