SPARQLthon17
提供:TogoWiki
第17回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。
目次 |
開催概要
- 開催期間:2014年2月17日(月) 10:00 〜 18日(火) 18:00
- 開催場所:ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 4階 415 (教室)
- アクセス:http://dbcls.rois.ac.jp/access
プロジェクト
- 次回以降の SPARQLthon 日程調整
- SPARQLthon 用 Google カレンダー に学会等の予定を追記してください。書き込み権は片山・川島・岡本にメールでリクエストください。
- スケジュールの空き状況を見て、候補日のリスト作り、SPARQLthon19 以降の日程を densuke などで希望調査してわりと先まで決めておこうと思っています。
- TogoGenome/TogoStanza
- UniProt 2014_01 + RefSeq 63 + EdgeStore (FALDO, クラス名, グラフ名改定対応)
- ID mapping
- NanoStanza
- Environment: 生物種数, 生育温度分布, 生育pH分布, 写真, 系統プロファイル etc.
- Organism: ゲノムサイズ, 遺伝子数, GC%, 生育温度, 生育pH, 表現型, application, disease, 系統プロファイル etc.
- Gene: 遺伝子長, exon数, AS数, オーソログ/生物種数, 立体構造, 論文, EC, 立体構造 etc.
- Human/Eukaryote genome RDF
- Nanopub
- 更新体制とサーバ移行準備
- Stanzaサーバ公開手順
- TogoDB/TogoWS
- MicrobeDB
- MBGD
- DDBJ
- GenomeRefine
- RDF
- VCF2RDF (BioInterchange/GVFO)
- PubChem, EBI, PDBj
- Glyco
- BioResource
- オントロジー
- 菌株
- taxdump 改定
- PIERO
参考リンク
- これまでの SPARQLthon
参加者
- 片山俊明(DBCLS)
- 川島秀一(DBCLS)
- 永野朗夫(PENQE)
- 岡別府陽子(MSS)
- 岡本忍(DBCLS)
- 竹原潤一(東工大)
- 大田達郎(DBCLS)(1日目だけ)
- 藤澤貴智(遺伝研)
- 山中遼太(先端研)
- 伊藤真和吏(医薬基盤研)
- 森宙史(東工大)
- 小林紀郎(理研)
- 櫻井望(かずさ)
- 小寺正明(東工大)(1日目だけ)
- 森田瑞樹(東大)(1日目だけ)
- 山本泰智(DBCLS)
- 山田一作(野口研)(1日目昼過ぎから)
- 有田正規(遺伝研)(2日目昼過ぎから)
- 荻島創一(東北大)