SPARQLthon94

提供：TogoWiki

第94回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。参加予定の方は、このページ下部の「参加者」欄にご記名ください。

目次 1 開催概要 2 参加手順 3 プロジェクト 3.1 TPP グループ全体 3.1.1 継続中 3.1.2 終了 3.2 SPARQLthon グループ 3.3 今後の予定 4 参考リンク 5 参加者

開催概要

• 開催期間：2020年 7月 30（木）- 31日（金）
• 開催連絡：biohackathon-jpメーリングリスト、および SPARQLthon Slack の #announcements チャンネルを参照ください

新コロ情勢に鑑み、今回も SPARQLthon 用の Pragli を使用した、オンライン開催となります。Pragli は Slack に似たインターフェイスで、

• Slack のワークスペースが Pragli のチーム
• Slack のチャンネルが Pragli のルーム

に対応しており、同じチームの同じルームにいる人とテレビ会議（カメラ、もしくはアバターと音声のみを選択）できます。 なお、画面共有機能はありますが、全参加者へのメッセージ送信やファイル共有などはなさそうなので、Slack と併用します。 ただし、1ルームあたり最大17人までという制限があるようなので、ラップアップは Zoom 等で行います（Slackで告知します）。

参加手順

• 0. この Wiki ページの下の方にある「参加者」の欄に名前を追記する
  • TogoWikiへのログイン・書き込みには DBCLS OpenID のアカウントが必要です
• 1. SPARQLthon の Slack に こちらの招待リンク から参加する
• 2. Slack の #announcements チャンネルに書かれている Pragli への招待リンクをクリックする
  • Zoom 爆撃的な荒らしを避けるためこちらの Wiki には招待リンクを記載していません
• 3. Pragli の SPARQLthon チームで、自分の取り組みたい課題のルームに参加するか、ルームを作成する
  • ルームは下記のように（手作業で）色分けしています
    • 赤色：オーガナイザー作成ルーム（初めての方用の #001-entrance やラップアップ用の #wrap-up など）
    • 紫色：各課題ごとの開発ルーム（打ち合わせや開発には主にこれらのルームを使用）
    • 水色：非公開プロジェクト関係者だけの鍵付きルーム（入室にはノックと承認が必要）
    • 黄色：ご自由にお使いくださいルーム（会議の前後には #workout や #coffee を）
    • 緑色：Pragliがデフォルトで作成するルーム（無言で過ごせる #silent-room など）
  • 新たにルームを作成した場合は、「Pragli 左上のメニュー＞Team settings＞Roomsタブ」でルーム名左の「#」をクリックして色を↑に揃えてください
  • 1ルーム17人までの制限あり
• 4. 各日 17:00 までにスライドに進捗を記載してラップアップ用の Pragli の #wrap-up チャンネルもしくは Zoom 等で進捗を報告する
  • 打ち合わせメモやレポートは Google slide で行います
  • SPARQLthon94スライド にテンプレートを用意しましたので適宜追加ください
    • （参考：SPARQLthon91スライド, SPARQLthon92スライド, SPARQLthon93スライド）
• 5. 夜はリモート飲みで交流しましょう（飲み物・ツマミは各自用意）🍶
  • 恒例のリカーソンですが、リモート開催の間は2日目の夜（今回だと7/31のラップアップ後）に行うことにします
  • 開催場所が変わった場合の連絡などは #liquorthon ルームのチャットや Slack を見てください

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

• データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
• 糖鎖科学ポータルの構築 (木下) - https://glycosmos.org/
• 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
• 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
• 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
• エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
• ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
• 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
• プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/

終了

• 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
• 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
• 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
• プロテオーム統合データベース：jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
• 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)

SPARQLthon グループ

今後の予定

参考リンク

• これまでの SPARQLthon

参加者

• 片山俊明 (DBCLS)
• 岡別府陽子（OKBP）
• 大田達郎 (DBCLS)
• 畠中秀樹 (DBCLS) 30昼過ぎまで、31全日
• 守屋勇樹 (DBCLS)
• 木下聖子 (創価大)
• 山本泰智 (DBCLS)
• 川島秀一 (DBCLS)
• 高月照江 (DBCLS)
• 若栗浩幸 (ビッツ) 30日(14:00まで), 31日(午前のみ)
• 大石直哉 (DOGRUN)
• 八塚茂（NBDC）
• 杉崎太一郎（MKI）
• 建石由佳（NBDC） 30日のみ
• 佐藤大輔 (Lifematics)
• 桝屋啓志（理研BRC）
• 高田豊之（理研BRC）
• 臼田大輝（理研BRC）
• 櫛田達矢（理研BRC）30日午後参加，３１日未定
• 山田一作（野口研究所）
• 井手隆広 (NBDC) 30日午後のみ
• 樋口千洋 (NIBIOHN)
• 信定知江 (NBDC) 30日午後のみ
• 千葉啓和 (DBCLS)
• 山口敦子 (東京都市大学) 30日午後
• 三橋信孝 (NBDC) 30日午後
• 平原麗夏（PENQE） 31日のみ
• 永野朗夫（PENQE）