SPARQLthon85
提供：TogoWiki
第85回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。
目次 |
開催概要
- 開催期間：2019年 10月 28（月）- 29日（火）
- 開催場所：ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) @ 東京大学 柏の葉キャンパス駅前 サテライト 6階
- アクセス：http://dbcls.rois.ac.jp/access
- 開催連絡：http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて
- 周辺の食事処 Google Map
プロジェクト
TPP グループ全体
継続中
- データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
- 新規ES検索インデックスに対応したアプリケーション実装 [やりかけ]
- MBGD RDF／TogoStanza更新とMicrobeDB.jpの更新連携 → RDF更新に合わせて、検索インデックス作成も依頼
- 植物ー微生物連携 → PlantGarden
- 糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
- 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
- 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
- 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
- エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
- ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
- 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
- プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/
終了
- 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
- 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
- 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
- プロテオーム統合データベース：jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
- 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)
SPARQLthon グループ
- AOE(坊農、大石)
- 更新するのにDBCLS SRA APIも更新の必要あり。それに対応させて、NIGスパコン上での更新成功。
- 微生物のにおいのDB化(畠中)
- RDFポータル利用促進のため、データセット間のつながりを整理(門間)
- RDF講習会の準備（岡別府・川島・片山）
- バイオリソースのRDF化のための、オントロジーについての打ち合わせ（川島、桝屋、川本、鐘ヶ江、櫛田、臼田、高月）
- 各センターや、各種リソースで必要な項目の洗い出しを実施
- 難病オントロジー構築（山田・仁宮・藤原）
今後の予定
参考リンク
- これまでの SPARQLthon
参加者
- 片山俊明 (DBCLS)
- 川島秀一 (DBCLS)
- 守屋勇樹 (DBCLS)
- 高月照江 (DBCLS)
- 坊農秀雅 (DBCLS)
- 仲里猛留 (DBCLS) 前日の朝に海外出張から帰ってくるので遅かったり来なかったりしたらゴメン
- 内藤雄樹 (DBCLS)
- 小野浩雅 (DBCLS)
- 千葉啓和 (DBCLS)
- 山口敦子 (DBCLS)
- 平木愛子 (DBCLS)
- 鐘ケ江弘美(NARO) 初日のみ
- 川本祥子(NIG/DBCLS)
- 池田秀也(DBCLS)
- 永野朗夫(PENQE）
- 黒須亮平(PENQE) 初日のみ
- 平原麗夏(PENQE) 初日のみ
- 浅野由衣(PENQE) 初日のみ
- 山田一作（野口研究所）２日目のみ ←すみません。参加できませんでした。
- 畠中秀樹 (DBCLS) 2日目は早退(15:30頃)
- 岡別府陽子(OKBP)
- 桝屋啓志(理研BRC)初日のみ
- 藤原豊史 (DBCLS)
- 有田正規（NIG)初日
- 藤澤貴智（NIG）
- 櫛田達矢（理研BRC）2日目は昼過ぎまで
- 臼田大輝（理研BRC）2日目は昼過ぎまで
- 建石由佳（NBDC）初日は午前のみ、2日目16時ごろまで
- 山田涼太（fuku）
- 仁宮洸太（東大） ２日目は午後から
- 李宣明（創価大）２日目のみ
- 大田達郎 (DBCLS)
- 田中聡 (Trans-IT) 初日のみ、17時まで
- 平川英樹（かずさ）初日の午後から
- 門間則和 (日立)
