SPARQLthon61

（版間での差分）

2017年11月7日 (火) 23:40時点における最新版

第61回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
- MicrobeDB.jpポータル開発#SPARQLthon61 （森、内山、西出、千葉、岡別府、藤澤）
- SPARQLthon61/MicrobeDB.jp-Umakaviewer（藤澤）
糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
- 複合糖質リポジトリの開発（山田、木下）
  - 糖脂質データの登録について、脂質のリポジトリがないので脂質リポジトの構築を検討することに
    - 脂質の同一性についてcanonical SMILES、MAP（WURCSで使っている修飾の表記法）の利用を検討することにした。
- ワークショップの打ち合わせ（山田、木下）
- Galaxy2の打ち合わせのメールを送信（山田、木下）
- 総合グライコミクスデータベースのRDF化の検討（三浦、山田）
  - 複合糖質のRDFスキーマの利用検討・使用可能オントロジー検索（SIO, CHEMINF）
蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/

バイオリソース情報のRDF化（川島・森・桝屋）
ローカルVirtuosoにアクセスするSBM抽出ツール開発 (山口)
NBDCのRDFストア群を事典風に見せるためにacetaminophenページのモック作成 (畠中)
RDF をグラフ DB にロードできる G2GML のプロト版作成（松本・山中）
/mw/INSDC (大田)
新着論文レビュー機能拡張の詳細検討（小野・山本・飯田・大石・建石）
TogoGenomeの更新 (2017_09) (岡別府)
GFAのドキュメント作成（大和田）
グラフゲノム可視化パイプライン（横山・大和田・原薗）
ChIP-seq ピーク情報のRDFスキーマ作成 (若栗)
グラフDBの利用を検討（千葉）
JavaScript版TogoStanza Web Component v1対応/jQuery排除 (守屋)
- linux_amd64 (for linux)
- darwin_amd64 (for mac)

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 * グラフゲノム可視化パイプライン（横山・大和田・原薗）
 * ChIP-seq ピーク情報のRDFスキーマ作成 (若栗)
-* Graph databasesの利用を検討（千葉）
+* グラフDBの利用を検討（千葉）
 * JavaScript版TogoStanza [/mw/SPARQLthon/togostanza_js#.E3.83.86.E3.82.B9.E3.83.88.E7.94.A8.E3.83.90.E3.82.A4.E3.83.8A.E3.83.AA Web Component v1対応/jQuery排除] (守屋)
 ** [https://drive.google.com/open?id=0B_NAUKeuU1pmejg1RVJtX0lmRXM linux_amd64] (for linux)