SPARQLthon60
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2017年9月25日 (月) 00:31時点における最新版
BioHackathon 2017 おつかれさまでした。第60回 SPARQLthon を下記日程で開催します。
目次 |
開催概要
- 開催期間：2017年 9月 21（木）- 22日（金）
- 開催場所：ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) @ 東京大学 柏の葉キャンパス駅前 サテライト 6階
- アクセス：http://dbcls.rois.ac.jp/access
- 開催連絡：http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて
プロジェクト
TPP グループ全体
H29〜
- データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
- 糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
- 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
- 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
- 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
- エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
- ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
継続中（〜H30）
〜H29
- 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
- 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
- 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
SPARQLthon グループ
- Virtuoso7.1のVALUES句で複数列複数行を指定すると値が返ってこなくなる不具合の対処方 VALUESのバグ (岡別府)
- Togovar Stanza （BioHackathonの続き）(建石、藤原）
- TogoGenome 比較ゲノム機能改訂 (佐藤、永野、片山）
- BH論文 改訂 co-authors 調整など (川島、片山)
- NBDC RDFポータル／DDBJメタデータ対応（藤澤）
- Orthology Ontology についての議論等 (BH17の続き)（千葉）
- データベース類似度マップの改善の検討（畠中）
今後の予定
- RDF化ガイドライン最新版 → RDFizingDatabaseGuideline
参考リンク
- これまでの SPARQLthon
参加者
5周年なので何かやりますか？ → 平目の刺身・キンキの煮付け・蕎麦がき（片山）、常陸牛のサイコロステーキ・茨城豚の照り焼き（高月）、龍馬の藁焼きカツオ（永野）、イベリコベジョータ・ソシースセッシェ・サラミボール（畠中）、盛岡の日本酒などなど
- 大田達郎 (DBCLS)
- 山口敦子 (DBCLS)
- 小野浩雅 (DBCLS)
- 岡別府陽子 (MSS) 21日のみ
- 千葉啓和 (DBCLS)
- 藤原豊史 (DBCLS) 22日のみ
- 川島秀一 (DBCLS)
- 片山俊明 (DBCLS)
- 永野朗夫 (penqe) 21日のみ、11:00〜
- 藤澤貴智 (遺伝研)
- 内藤雄樹 (DBCLS) 21は午後から
- 大和田周甫 (東工大) 21日のみ
- 佐藤大輔 (レベルファイブ)
- 田中聡 (Trans-IT) 21日のみ
- 畠中秀樹 (NBDC) 22日のみ
- 建石由佳 (NBDC)
