SPARQLthon44

提供：TogoWiki

第44回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次 1 開催概要 2 プロジェクト 2.1 TPP グループ全体 2.2 SPARQLthon グループ 2.3 今後の予定 3 参考リンク 4 参加者

開催概要

• 開催期間：2016年 5月26日(木) 10:00 〜 27日(金) 18:00
• 開催場所：遺伝学研究所 (26日) 生命情報研究棟西棟 DBCLS (27日) 生命情報研究センター棟 (DDBJ棟) 4F会議室 (W403-405)
• アクセス：http://dbcls.rois.ac.jp/access
  • 遺伝研行きのシャトルバスがあります。乗り口は北口から出てロータリー向かって左手です。
  • 新幹線ーNIGシャトルバス接続情報
  • 9:30出発のシャトルバスに乗ってお越しいただくと、DDBJ棟までご案内します。
    • 関東方面からお越しの方は こだま639号 (東京8:26発、品川8:34発) がスムーズです。
    • 関西方面からお越しの方は こだま632号 (名古屋7:29発) がスムーズですが、朝が早いので前泊する方が楽です。
• お昼について
  • 所内には小さい食堂がありますが、売店などはありません。お弁当などをお持ち頂くことをお勧めします。
    • 参考: ランチスポット情報 [三島グルメ]
• 夕食について
  • 初日の夕食は三嶋大社の向かいの大社の杜におでかけします http://www.taishanomori.jp
    • 雨天の場合は遺伝研で軽食を取ってから適当に解散します
• ホテルについて
  • 駅の周りのホテル
    • ホテルアルファワン http://www.alpha-1.co.jp/mishima/ 南口。INSDCミーティングの時に使ってるホテルその1
    • ホテルマッシモ三島 http://www.massimo-m.jp 南口。INSDCミーティングの時に使ってるホテルその2
    • 東横イン http://www.toyoko-inn.com/hotel/00215/ 北口。あんまりお店がない方(北口)だけど遺伝研行きシャトルバス乗り場に近い方
    • ドーミーイン http://www.hotespa.net/hotels/mishima/ 南口。トレインビュー＆富士山ビュー。温泉があります
• 開催連絡：http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて

プロジェクト

TPP グループ全体

• 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
• ゲノムとフェノタイプ・疾患・医薬品の統合データベース (金久)
• ゲノム・メタゲノム情報統合による微生物ＤＢの超高度化推進 (黒川)
• 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オミクスデータの統合 (菅野)
• 植物ゲノム情報活用のための統合研究基盤の構築 (田畑)
• 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
• 蛋白質構造データバンクの高度化と統合的運用 (中村)
• 糖鎖統合データベースおよび国際糖鎖構造リポジトリの開発 (成松)
  • GlyTouCan<->PDBj （山田）
• 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
  • [NBRP Rat 特性検査項目と、パラメーターオプションの値のRDF化作業](高月)
• 生命動態システム科学のデータベースの統合化（大浪）
• プロテオーム統合データベース：jPOST（石濱）
  • データベースのシステム開発のためのダミーRDF作成中（守屋）

SPARQLthon グループ

• Ortholog
• JSTシソーラスオントロジー化試験作業（櫛田、古崎）
• SPARQL Builder
  • BHでの作業とその準備について打ち合わせ
  • パスランキングの実装，メタデータ更新
• KEGG OC RDF データ更新（守屋）
• BH12.12/SPARQL11test（山本）

今後の予定

• RDF化ガイドライン最新版 → RDFizingDatabaseGuideline
• IIBMP2016 セッション？

参考リンク

• これまでの SPARQLthon
• SPARQLthon44終了した次の日2016/05/28(土)の 13:00 〜 17:00 に三島の隣駅沼津にて、三島エリアのライフサイエンス業界勉強会 Mishima.syk #8 http://connpass.com/event/29258/ が開催されます。奮ってご参加下さい!
  • 懇親会も募集中です http://connpass.com/event/29257/

参加者

• 片山俊明 (DBCLS)
• 川島秀一 (DBCLS)
• 守屋勇樹 (DBCLS)
• 坊農秀雅 (DBCLS)
• 大石直哉 (DOGRUN)
• 岡別府陽子(MSS)
• 大田達郎 (DBCLS)
• 山口敦子 (DBCLS)
• 永野朗夫 (PENQE)
• 山田一作（野口研究所）
• 金城玲 (PDBj)
• 千葉啓和（基生研）
• 森宙史（東工大）
• 黒川顕（遺伝研）
• 藤澤貴智（遺伝研）
• 古崎晃司（大阪大学）
• 山本泰智 (DBCLS)
• 桝屋啓志 (理研BRC)
• 高月照江 (理研BRC）
• 小澤健太郎 (SGI) 26日のみかも
• 宮崎聡 (involute) 26日のみ
• 山本希（遺伝研）
• 内藤雄樹 (DBCLS)
• 小野 浩雅 (DBCLS)
• 田中聡 (Trans-IT) 27日は午後のみ
• 櫛田達矢（NBDC）26日のみ
• 戀津魁（理研）26日のみ
• 平川英樹 (かずさDNA研) 26日午後のみ
• 市原寿子 (かずさDNA研) 27日のみ 風邪による体調不良の為、出席を撤回致します。申し訳ありません。
• 櫻井望 (かずさDNA研)　26日のみ
• 中村保一（遺伝研・かずさDNA研）出たり入ったりです。スンマセン
• 小林 紀郎 (理研)　26日のみ
• 信定知江（NBDC）両日15時過ぎまで。申し訳ありません。
• 東光一（遺伝研）26日のみ
• 山中遼太（Oracle）27日のみ