SPARQLthon23/LiteratureID

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目次 1 文献 ID のための URI 1.1 DOIやPubMedIDのURLの例 1.2 DOIとPubMed IDの取得 1.3 検索ワード 1.4 文献情報リストの一括検索

文献 ID のための URI

櫛田さんから、文献についての調査報告がありました（8/19)

TPP 各グループのデータ分野とRDF化対象の表 で、文献のところを調査することになっていますが、KNApSAcKの文献情報を使って個々の文献の識別にどのIDが使えそうか検討してみました。結論ですが、

• DOI、もしくは
• PubMed ID

を使うのがよさそうで、それ以外のもの（DOI, PubMed IDがともについていないもの、書籍、学位論文など）はさらに別に検討する必要がありそうです。

DOIやPubMedIDのURLの例

DOIの場合

• http://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2005.11.020

PubMed IDの場合

• http://pubmed.org/17376494
• http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17376494

になります。

DOIとPubMed IDの取得

DOIおよびPubMed IDの取得は、DOIを発行している機関が提供している検索サービスが使えそうです。

• crossref SimpleTextQuery（登録必要、無料）

例えば、検索ワードとして、Phytochem.,68,(2007),1212とした場合、

• http://dx.doi.org/10.1016/j.phytochem.2007.01.020
• PMid:17376494 PMCid:PMC2735499

の情報を取得することができます。

検索ワード

• 文献名（省略記述でも可能、例、J.Nat.Prod）、巻号、発行年、ページの情報があればよいです。
• 著者名があってもよいのですが、間違って入力すると、「結果なし」となってしまうことが多いので、著者名は入れないほうが経験的にはよいです。

文献情報リストの一括検索

knapsack_coreで使われている文献の一部について調べてみたところ、

• DOIがつく文献は、70%程度、
• PubMed IDがつく文献は、30%程度、
• DOI, PubMed IDどちらもつかない文献は、25%程度でした。

以上、検討途中ですが簡単にご報告まで。