SPARQLthon23/LiteratureID

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文献 ID のための URI

櫛田さんから、文献についての調査報告がありました(8/19)

TPP 各グループのデータ分野とRDF化対象の表 で、文献のところを調査することになっていますが、KNApSAcKの文献情報を使って個々の文献の識別にどのIDが使えそうか検討してみました。結論ですが、

  • DOI、もしくは
  • PubMed ID

を使うのがよさそうで、それ以外のもの(DOI, PubMed IDがともについていないもの、書籍、学位論文など)はさらに別に検討する必要がありそうです。

DOIやPubMedIDのURLの例

DOIの場合

PubMed IDの場合

になります。

DOIとPubMed IDの取得

DOIおよびPubMed IDの取得は、DOIを発行している機関が提供している検索サービスが使えそうです。

例えば、検索ワードとして、Phytochem.,68,(2007),1212とした場合、

の情報を取得することができます。

検索ワード

  • 文献名(省略記述でも可能、例、J.Nat.Prod)、巻号、発行年、ページの情報があればよいです。
  • 著者名があってもよいのですが、間違って入力すると、「結果なし」となってしまうことが多いので、著者名は入れないほうが経験的にはよいです。

文献情報リストの一括検索

knapsack_coreで使われている文献の一部について調べてみたところ、

  • DOIがつく文献は、70%程度、
  • PubMed IDがつく文献は、30%程度、
  • DOI, PubMed IDどちらもつかない文献は、25%程度でした。

以上、検討途中ですが簡単にご報告まで。

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