SPARQLthon100

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2021年1月28日 (木) 04:19時点における最新版

第100回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。参加予定の方は、このページ下部の「参加者」欄にご記名ください。

開催概要

記念すべき第100回ですが、緊急事態宣言発出中ですので、残念ながら今回はオンライン開催となります。

開催期間：2021年 1月 28（木）- 29日（金）
開催連絡：biohackathon-jpメーリングリスト、および SPARQLthon Slack の #announcements チャンネルを参照ください

まだフリーで利用できるようですので、今回も SPARQLthon 用の Pragli を使用します。Pragli は Slack に似たインターフェイスで、

Slack のワークスペースが Pragli のチーム
Slack のチャンネルが Pragli のルーム

に対応しており、同じチームの同じルームにいる人とテレビ会議（カメラ、もしくはアバターと音声のみを選択）できます。なお、画面共有機能はありますが、全参加者へのメッセージ送信やファイル共有などはなさそうなので、Slack と併用します。

参加手順

0. この Wiki ページの下の方にある「参加者」の欄に名前を追記する
- TogoWikiへのログイン・書き込みには DBCLS OpenID のアカウントが必要です
1. SPARQLthon の Slack にこちらの招待リンクから参加する
2. Slack の #announcements チャンネルに書かれている Pragli への招待リンクをクリックする
- Zoom 爆撃的な荒らしを避けるためこちらの Wiki には招待リンクを記載していません
3. Pragli の SPARQLthon チームで、自分の取り組みたい課題のルームに参加するか、ルームを作成する
- ルームは下記のように（手作業で）色分けしています
  - 赤色：オーガナイザー作成ルーム（初めての方用の #001-entrance やラップアップ用の #wrap-up など）
  - 紫色：各課題ごとの開発ルーム（打ち合わせや開発には主にこれらのルームを使用）
  - 水色：非公開プロジェクト関係者だけの鍵付きルーム（入室にはノックと承認が必要）
  - 黄色：ご自由にお使いくださいルーム（会議の前後には #workout や #coffee を）
  - 緑色：Pragliがデフォルトで作成するルーム（無言で過ごせる #silent-room など）
- 新たにルームを作成した場合は、「Pragli 左上のメニュー＞Team settings＞Roomsタブ」でルーム名左の「#」をクリックして色を↑に揃えてください
- 1ルーム17人までの制限あり
- P2P など特殊なポート番号へのアクセスをファイアウォールで制限している組織からは繋がらない場合があるようです
- 全員に一斉連絡するための機能 (Discussion) がついた模様 (2020/10)
4. 各日 17:00 までにスライドに進捗を記載して（人数制限を避けるため） Zoom (1日目, 2日目) でラップアップを行います
- 打ち合わせメモやレポートは Google slides で行います。SPARQLthon100スライドにテンプレートを用意しましたので適宜追加ください
  - （参考： SPARQLthon99スライド, SPARQLthon98スライド, SPARQLthon97スライド, SPARQLthon96スライド, SPARQLthon95スライド, SPARQLthon94スライド, SPARQLthon93スライド, SPARQLthon92スライド, SPARQLthon91スライド）

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
糖鎖科学ポータルの構築 (木下) - https://glycosmos.org/
蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/

終了

SPARQLthon グループ

必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行）

今後の予定