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== 検討課題 == PubMed や、DOI などのリソースが使えない文献情報をRDF化するのに、誰かURIを提供するデータベースを運用してくれないか。 TogoDB で作ればいいのではないか。 == 使えそうな識別子 == *PMID *DOI *J-GLOBAL（国内） *CiNii論文ID（NAID） *JAIRO ID（機関レポジトリに収録されている国内の学術論文、学位論文、研究紀要、研究報告書） *国内紀要などだと、NAIDなどしかつかないものもあり **例：KNApSAcKで1201 化合物-生物種ペアに引用されている紀要: Umezawa,Wood Res.,No.90,(2003),27 （Phylogenetic Distribution of Lignan Producing Plants）→NII Article ID (NAID) : 110004665751 (http://ci.nii.ac.jp/naid/110004665751) == 現状と課題 == *PMID,DOIなどつかないものの取扱い →海外のマイナー雑誌などが対象 **内輪のIDを付与？　TPP関係はNBDCがふる？ **リテラルで書き下す？　書式の標準化？　既存の書式？ ***PMIDなどのIDがつく前にReferenceが必要になることがある（DDBJなど） ****あとからIDがついてくる ****GenomeRDFのリファレンス記述例（藤澤さん） *効率的にリンクをつける方法は？ **PMIDを効率的につける方法は？ *** [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog/journals NLM Catalog: Journals referenced in the NCBI Databases] **DOIを効率的に付与する方法 *** [http://www.crossref.org/SimpleTextQuery/ CrossRef Simple Text Query Form]（全部ではない？） ****表記揺れ、スペルミスはある程度吸収 ****表記法によって、帰ってくる結果が変わる場合があるっぽい **DOIとPMID、PMCID間の変換はNCBIで可能　 *** [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/tools/id-converter-api/ PMC ID Converter API] **ID検索の前段階で表記ゆれなどをどうするか？ →金さんに相談？ *** 山本さんの [http://colil.dbcls.jp/browse/papers/ Colil] 用の実装が使えるかも *** [http://aws.amazon.com/jp/mturk/ Amazon Mechanical Turk] が使えるかも（現状では日本からは利用できない） *** 日本国内では [http://www.lancers.jp ランサーズ]や[http://crowdworks.jp/ クラウドワークス] などのサービスが使えるとのこと *IDとリンクする際に、表記揺れなどで当たらない **表記の揺れ方 ***略記法の揺れ ***雑誌の別名　例、非英語圏で非英語名と英語名で同じ雑誌をさす場合がある *PMID: DOI: 両方を持つものの取扱い **NBDCのヒトDBは両方ある場合には DOI: を優先的に表示　→（理由）本文への到達可能性が高い *** 両方出すべきでは？ *文献の標準的な記載法は？ *化合物に限らない文献記載の問題点 **培地論文 **遺伝研　中村先生、山崎先生など（植物系の古い論文・書籍） *KNApSAcKの文献RDF化の問題点 **記載の正確性の問題（キュレーションが必要）→櫻井さんと要相談 == リソース一覧 == * [http://kanaya.naist.jp/knapsack_jsp/top.html KNApSAcK] → [http://kanaya.naist.jp/knapsack_jsp/information.jsp?mode=r&word=C00000001&key=0| KNApSAcKのエントリ例] * [http://mcc.nies.go.jp/referenceSearchInit.do?authorIndex=A&forwardType=8| NIES culture collection references] * [http://www.nbrc.nite.go.jp/NBRC2/NBRCReferenceDetailServlet?NO=5| NBRC sample] * [http://jcm.brc.riken.jp/ja/result| JCM sample] * [http://www.crossref.org/titleList/ CrossRef title list] * DDBJ/ENA/GenBank/RefSeq → [[References_wo_PMID/GenomeRDF|Genome RDFのリファレンス記述例]]

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