BH12.12/stanza titech/metagenome sample list revised
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metagenome sample list / meta16S sample list
- スタンザ概要--------------------------
- ある環境から採取されたメタゲノムサンプルのリスト
- ある環境から採取されたメタ16Sサンプルのリスト
- 入力----------------------------------
- MEO_ID
- 出力----------------------------------
変数名 | 説明 | URI or literal |
---|---|---|
?SRS_ID | SRS ID | URI |
?MEO_term_list | MEO termの列挙 | literal |
- 使用グラフ----------------------------
- メモ----------------------------------
- MEO_0000437はsampledFromEnv
- MEO_0000441はinvestigation_type
- SPARQL query--------------------------
例:メタデータにMEO_0000054(feces)を持つメタゲノムデータのリスト
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> PREFIX srs: <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/> PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/> PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#> SELECT DISTINCT ?SRS_ID (GROUP_CONCAT(?MEO_label ; SEPARATOR = " , ")AS ?MEO_term_list) FROM <http://microbedb.jp/ncbitaxon/> FROM <http://microbedb.jp/srs/> FROM <http://microbedb.jp/meo/> WHERE{ ?SRS_ID meo:MEO_0000441 "metagenome". #investigation_type ?SRS_ID meo:MEO_0000437 ?MEO_ID. ?MEO_ID rdfs:label ?MEO_label. }order by ?SRS_ID