SPARQLthon34/DBcatalog
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SPARQLthon33/DBcatalog の続き カテゴリーの見直しおよびオントロジーの作成は公開後に行なう。まずは公開する方向で理研メタデータとの突き合わせを進めた。
目次 |
更新の手順
- 現状のカテゴリーのリストアップ(信定)→ https://docs.google.com/spreadsheets/d/10WRwuLS-_jJHPz4sKtRXAq_kaIj54xq8r4fqS3xNtyA/edit?usp=sharing 【Done】
- 理研メタデータベースカテゴリーとのマッピング(信定)【Done】
- カテゴリーのリソース URIを確定する(藤澤)【Done】
- 関係者に確認(信定・小林)
- RDF更新(大久保)
- NBDCポータルサイトに入れる(大久保)
- オントロジーを作る
- 現状のカテゴリー(タグ)の見直し(信定)
- 階層化、破綻しないオントロジー作成のフロー(古崎)
理研メタデータとの突き合わせ
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1i_Mq-uEGQsZSPI2gCa0r4f4MVHnu4wsu4B6slokZqr0/edit?usp=sharing
- "category:Target"について
- カタログには無いが理研で使用しているカテゴリ(experiment, metabolism, phenotype, transcript)は追加。
- 理研で使用していないが、カタログで使用している(または理研とカタログで意味が完全一致しない)カテゴリを追加。
- "category:Information type"について
- カタログでもっている「Ontology/ Terminology/Nomenclature」を理研が使っていなかったが、これは追加。
- 今後も理研からリクエストがあれば随時追加予定。
理研メタデータベースからのリンク
- 理研メタデータベースからintegbiodbレコードへのリンクするための表現について、いったん理研側で独自のプロパティで記述する。
- カテゴリーのオントロジーを作る際、OWLにRecord, Datasetクラスなども記述する。
integbiodbオントロジー
- カテゴリーの他にRecordクラスを定義する
@prefix integbio: <http://integbio.jp/dbcatalog/resource/integbio.owl#> <http://metadb.riken.jp/db/xxxxxx> rdfs:seeAlso <http://integbio.jp/dbcatalog/resource/nbdcXXXXXXXX> . <http://integbio.jp/dbcatalog/resource/nbdcXXXXXXXX> rdf:type integbio:Record .
http://integbio.jp/dbcatalog/resource/integbio.owl#
:Record a owl:Class ; rdfs:label “Integbio Database Record" ; rdfs:subClassOf dcat:CatalogRecord .