BH12.12/TogoAnnotator

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目次

プロジェクト履歴

プロジェクト概要

  1. 配列相同性での自動遺伝子アノテーションパイプラインの結果を入力にして、NITEゲノムアノテーションルールを適用した遺伝子名を出力する
  2. オルソログクラスターに含まれる遺伝子名を入力にして、適切な遺伝子名を生成する

進捗

サブプロジェクト1 Day3 11:00-12:00, 15:00-16:00ミーティング -ickw, so, yy

  • 入出力ファイルの確認
  • 処理仕様の確認
  • TogoAnnotatorによるテスト処理
  • 結果を市川さんに見てもらう
    • 処理ルールが必要な遺伝子名のリストアップ
    • ルールの明文化
  • NLPパラメーターのチューニング

サププロジェクト2 Day3 13:00-13:30 -ucym, cb, yy, so

  • MBGDFオルソログクラスターへの適用について
    • MBGDオルソログクラスター名として使いたい
    • オルソログクラスターのツリーを構成タンパク質の名前をもとにして分割したい
  • MBGD OC_ID -- 構成タンパク質名のリストが欲しい

メンバー

  • 山本さん (yy)
  • 藤澤さん (tf)
  • 市川さん (ickw)
  • 内山さん (ucym)
  • 千葉さん (cb)
  • 岡本 (so)
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