BH11.11/セマンティックゲノムアノテーションデータベースの試作/CyanoBase

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metadata.ttl

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gene.ttl

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<http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/NIES39/genes/NIES39_A00010>       kazusa:genomic_context  <http://g.kazusa.or.jp/cgi-bin/gbrowse_img/NIES39/?name=Chr:-1848..2412;type=Locus;width=480;keystyle=between;grid=on;h_feat=NIES39_A00010@yellow> .

CyanoBaseで扱っているINSDC FeaturesとSOの対応

INSDC Features	SO Accession	SO term
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CDS	SO:0000316	CDS
tRNA	SO:0000253	tRNA
rRNA	SO:0000252	rRNA
ncRNA	SO:0000655	ncRNA
tmRNA	SO:0000584	tmRNA
misc_feature	SO:0000001	region
misc_RNA	SO:0000673	transcript