SPARQLthon98

提供：TogoWiki

2020年11月26日 (木) 14:31時点におけるYayamamo (トーク | 投稿記録)による版

第98回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。参加予定の方は、このページ下部の「参加者」欄にご記名ください。

開催概要

新コロ情勢に鑑みオンライン開催を続けてきましたが、オンラインでは新しいコラボレーションやクリエイティブな議論は難しいことが分かってきたため、今回からオフライン開催に復帰していこうと思います（状況によりオンラインに戻る可能性あり、会場の様子をオンライン参加者用に中継する可能性あり）。

開催期間：2020年 11月 26（木）- 27日（金）
- なお、27日は 17:00〜 DBCLSサーバの入居する三島の遺伝研が法令停電のため、夕方までに終了予定です
開催場所：DBCLS柏の葉
- 外部の方は1Fで検温のち、入館届(1Fと6Fに設置)に記入しDBCLSに提出してください
- 6Fの入り口に鍵がかかっている場合、電話やSlackなどでお知らせください
開催連絡：biohackathon-jpメーリングリスト、および SPARQLthon Slack の #announcements チャンネルを参照ください
- SPARQLthon Slack の招待リンク (有効期限が切れていたらご連絡ください、更新します)

参加手順

この Wiki ページの下の方にある「参加者」の欄に名前を追記する
- TogoWikiへのログイン・書き込みには DBCLS OpenID のアカウントが必要です

各日 17:00 までにスライドに進捗を記載してラップアップを行います
- [SPARQLthon98] にテンプレートを用意しましたので適宜追加ください
  - （参考： SPARQLthon97スライド, SPARQLthon96スライド, SPARQLthon91スライド, SPARQLthon92スライド, SPARQLthon93スライド, SPARQLthon94スライド, SPARQLthon95スライド）

オンライン参加の場合

SPARQLthon の Slack で中継用 URL など情報共有予定です
Slack の #announcements チャンネルに書かれている Pragli も併用する可能性があります

Pragli について

Pragli は Slack に似たインターフェイスで、

Slack のワークスペースが Pragli のチーム
Slack のチャンネルが Pragli のルーム

に対応しており、同じチームの同じルームにいる人とテレビ会議（カメラ、もしくはアバターと音声のみを選択）できます。

Pragli の SPARQLthon チームで、自分の取り組みたい課題のルームに参加するか、ルームを作成する
- ルームは下記のように（手作業で）色分けしています
  - 赤色：オーガナイザー作成ルーム（初めての方用の #001-entrance やラップアップ用の #wrap-up など）
  - 紫色：各課題ごとの開発ルーム（打ち合わせや開発には主にこれらのルームを使用）
  - 水色：非公開プロジェクト関係者だけの鍵付きルーム（入室にはノックと承認が必要）
  - 黄色：ご自由にお使いくださいルーム（会議の前後には #workout や #coffee を）
  - 緑色：Pragliがデフォルトで作成するルーム（無言で過ごせる #silent-room など）
- 新たにルームを作成した場合は、「Pragli 左上のメニュー＞Team settings＞Roomsタブ」でルーム名左の「#」をクリックして色を↑に揃えてください
メモ
- 1ルーム17人までの制限あり
- P2P など特殊なポート番号へのアクセスをファイアウォールで制限している組織からは繋がらない場合があるようです
- 全員に一斉連絡するための機能 (Discussion) がついた模様 (2020/10)

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
糖鎖科学ポータルの構築 (木下) - https://glycosmos.org/
蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/

終了

SPARQLthon グループ

必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行）

今後の予定