BH12.12/TogoAnnotator
提供：TogoWiki
目次 |
プロジェクト履歴
プロジェクト概要
- 配列相同性での自動遺伝子アノテーションパイプラインの結果を入力にして、NITEゲノムアノテーションルールを適用した遺伝子名を出力する
- オルソログクラスターに含まれる遺伝子名を入力にして、適切な遺伝子名を生成する
進捗
サブプロジェクト１ Day3 11:00-12:00, 15:00-16:00ミーティング -ickw, so, yy
- 入出力ファイルの確認
- 処理仕様の確認
- TogoAnnotatorによるテスト処理
- 結果を市川さんに見てもらう
- 処理ルールが必要な遺伝子名のリストアップ
- ルールの明文化
- NLPパラメーターのチューニング
サププロジェクト２ Day3 13:00-13:30 -ucym, cb, yy, so
- MBGDFオルソログクラスターへの適用について
- MBGDオルソログクラスター名として使いたい
- オルソログクラスターのツリーを構成タンパク質の名前をもとにして分割したい
- MBGD OC_ID -- 構成タンパク質名のリストが欲しい
- MBGD SPARQL endpointから取得可能 (SPARQLクエリ)
メンバー
- 山本さん (yy)
- 藤澤さん (tf)
- 市川さん (ickw)
- 内山さん (ucym)
- 千葉さん (cb)
- 岡本 (so)
