TPP-nakamura
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| 概 要 || PDB(蛋白質構造データバンク)とBMRB(NMR実験情報データバンク)を日米欧の国際協力により継続的に構築・公開し、特に蛋白質・リガンド複合体構造データ登録の仕組みを整備する。また、これまでに開発した統合化技術に基づき二次データベースと種々のサービスを高度化する他、利用者・登録者への教育とアノテータの育成を行い、他の生命データベースとの統合化による構造生命科学の基盤を与える研究開発とする。 | | 概 要 || PDB(蛋白質構造データバンク)とBMRB(NMR実験情報データバンク)を日米欧の国際協力により継続的に構築・公開し、特に蛋白質・リガンド複合体構造データ登録の仕組みを整備する。また、これまでに開発した統合化技術に基づき二次データベースと種々のサービスを高度化する他、利用者・登録者への教育とアノテータの育成を行い、他の生命データベースとの統合化による構造生命科学の基盤を与える研究開発とする。 | ||
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+ | * [https://www.ebi.ac.uk/pdbe/docs/sifts/ PDBe SIFTS] のデータのRDF化→できた。(公開が問題) | ||
+ | * [http://rdf.wwpdb.org/ wwPDB/RDF] の修正(NBDCのconventionに合わせる)dcterms:identifier など。もう一息? |
2016年3月24日 (木) 08:43時点における最新版
研究開発課題名 | 蛋白質構造データバンクの高度化と統合的運用 |
研究代表者 | 中村 春木 |
所属・役職 | 大阪大学 蛋白質研究所 所長/教授 |
概 要 | PDB(蛋白質構造データバンク)とBMRB(NMR実験情報データバンク)を日米欧の国際協力により継続的に構築・公開し、特に蛋白質・リガンド複合体構造データ登録の仕組みを整備する。また、これまでに開発した統合化技術に基づき二次データベースと種々のサービスを高度化する他、利用者・登録者への教育とアノテータの育成を行い、他の生命データベースとの統合化による構造生命科学の基盤を与える研究開発とする。 |
SPARQLthon 42
- PDBe SIFTS のデータのRDF化→できた。(公開が問題)
- wwPDB/RDF の修正(NBDCのconventionに合わせる)dcterms:identifier など。もう一息?