SPARQLthon18/DBcatalog
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+ | * データベースの概要を掴むための基本的な情報(URL、説明、生物種など)を記述したメタデータ(カタログデータ)のRDF化を行う。 | ||
+ | * 既存のスキーマ (例:[https://docs.google.com/a/lsdb.jp/spreadsheet/ccc?key=0Aoy0zfdRviKsdFJWTDFpblNXc3BtelhrdEpNYTdvbXc#gid=1, HCLS dataset description], JST知識インフラ)を可能な限り参考にして汎用的に用いられている語彙を利用する。 | ||
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2014年3月14日 (金) 08:52時点における最新版
概要
- BH13.13の以下の続き。
/mw/index.php?title=BH13.13/dbcatalog
- データベースの概要を掴むための基本的な情報(URL、説明、生物種など)を記述したメタデータ(カタログデータ)のRDF化を行う。
- 既存のスキーマ (例:HCLS dataset description, JST知識インフラ)を可能な限り参考にして汎用的に用いられている語彙を利用する。
進捗
- 生物種 (Taxonomy ID)
dcat:organism <http://identifiers.org/taxonomy/9606>
→上記BH13.13の内容の修正
#Japanese record <http://integbio.jp/dbcatalog/ja/record/nbdc01381-data> rdf:type dct:Dataset; dct:title "Strawberry GARDEN"@ja; dct:alternative "Strawberry Genome And Resource Entry"@ja; dct:description "食用イチゴのゲノムに関するデータベースです。栽培品種であるFragaria x ananassaのゲノムを近縁野生種4種と比較し、公開されている1品種のゲノム上にマップして得られた遺伝子の、シーケンスやアノテーション情報を収 録しています。データはキーワードやBLASTによる検索が可能です。マーカーリストのデータベースも含んでいます。"@ja; dct:creator _:a1075; foaf:page <http://strawberry-garden.kazusa.or.jp/>; // rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/3747>; rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/64939>; rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/101012>; rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/60188>; rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/101013>; rdfs:seeAlso <http://identifiers.org/taxonomy/57918>; <http://identifiers.org/taxonomy/3747> rdfs:label "Fragaria x ananassa"; <http://identifiers.org/taxonomy/3747> rdf:type <http://identifiers.org/taxonomy/> . <http://identifiers.org/taxonomy/64939> rdfs:label "Fragaria iinumae"; <http://identifiers.org/taxonomy/64939> rdf:type <http://identifiers.org/taxonomy/> . <http://identifiers.org/taxonomy/101012> rdfs:label "Fragaria nipponica"; <http://identifiers.org/taxonomy/101012> rdf:type <http://identifiers.org/taxonomy/> . <http://identifiers.org/taxonomy/60188> rdfs:label "Fragaria nubicola"; <http://identifiers.org/taxonomy/60188> rdf:type <http://identifiers.org/taxonomy/> . <http://identifiers.org/taxonomy/101013> rdfs:label "Fragaria orientalis"; <http://identifiers.org/taxonomy/101013> rdf:type <http://identifiers.org/taxonomy/> .
- 多言語化対応(日英のメタデータ)
- 案1. Propertyは同じで、リテラルで記述する項目では、言語タグ@langで日英の情報を併記する。→ボツ. レコード公開日/最終更新日など日英レコードで異なる記述の項目が存在する。
- 案2.日英のレコードを独立のリソースとして扱う。
# description about the DB catalog entry <http://integbio.jp/dbcatalog/ja/record/nbdc01381-id> a void:DatasetDescription; dct:title "Strawberry GARDEN databaseのレコード"@ja; dct:description "integbioデータベースカタログの Strawberry GARDENのレコード"@ja; dct:identifier "NBDC01381"^^xsd:string; dct:creator _:b1075; nbdc:sourceDataset <http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01381>; dct:language <http://www.lexvo.org/page/iso639-3/jpn>; dct:created "2014-01-20T00:00:00Z"^^xsd:dateTime; dct:modified "2014-01-20T00:00:00Z"^^xsd:dateTime; foaf:primaryTopic <http://integbio.jp/dbcatalog/ja/record/nbdc01381-data>. _:b1075 rdf:type <http://xmlns.com/foaf/0.1/Organization>; rdfs:label "独立行政法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター"@ja; dct:label “独立行政法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター"@ja; dbpedia:country <http://dbpedia.org/resource/Japan>.