SPARQLthon17/CrossSearch
提供:TogoWiki
目次 |
これまでの取り組みなど(参考となるページ)
- BH13.13でのグループページ --[1]
- BH12でのグループのページ -- https://github.com/dbcls/bh12/wiki/Schema.org-extension
- BH12.12でのグループのページ -- /mw/index.php/BH12.12/schema.org
- 生命科学データベースのためのSagaceマークアップ・スキーマ -- http://sagace.nibio.go.jp/schema/schema.html
- 現在Sagaceでサポートしているプロパティとマークアップ方法の解説-- http://sagace.nibio.go.jp/press/metadata/markup/
- RDFグラフの視覚化 Turtle, Microdata, JSON-LD (可視化ツール) -- http://www.kanzaki.com/works/2009/pub/graph-draw
Schema.org資料
HTML仕様
- flow contentに属するものがhead要素外で利用可能
DDBJリソースURI表示ウェブサイトでのマークアップ
疑問
- itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase" でOWLを指定していいものか → 想定外
- itemprop="name” を複数記述してもよい?
- itemprop="id”、itemprop="url"を複数指定した時の対応関係は? 1つのみの制約等あるか? → itemprop="seeAlso”内で1つ。itempropの親子関係図示。
CyanoBaseでのマークアップ(例)
<div itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="isEntryOf" itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase"> <a itemprop="url" href="http://genome.microbedb.jp/cyanobase"><span itemprop="name">CyanoBase</span></a> </span> <span itemprop="entryID">Synechocystis</span> </div> <div itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="taxon" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="name">Synechocystis sp. PCC 6803</span> <a itemprop="url" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=1148"><span itemprop="entryID">1148</span></a> </span> </div> <div itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop='reference' content='pmid:23110816' > <a href=“http://pubmed.org/23110816">pmid:23110816</a> </span> </div> <div itemprop="seeAlso" itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="isEntryOf" itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase"> <span itemprop="name”>TogoAnnotation</span> <a itemprop="url" href=“http://togo.annotation.jp/annotation/【ID】"><span itemprop="entryID”>【ID】</span></a> </span> </div>
Microdata Extractor によるパース結果
BiologicalDatabase_url=http://genome.microbedb.jp/cyanobase BiologicalDatabase_name=CyanoBase BiologicalDatabaseEntry_entryID=Synechocystis BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_name=Synechocystis sp. PCC 6803 BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=1148 BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_entryID=1148 BiologicalDatabaseEntry_reference= pmid:23110816
RDFグラフの視覚化 Turtle, Microdata, JSON-LDで可視化
DDBJ Taxonomy ontologiesマークアップ(例)
<!-- isEntryOf --> <div style="display:none" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="isEntryOf" itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase"> <a itemprop="url" href="http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/taxonomy/taxonomy.owl"> <span itemprop="name">DDBJ Taxonomy ontologies</span> </a> </span> <span itemprop="entryID">1148</span> </div> <!-- taxon --> <div style="display:none" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="taxon" itemscope itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="name">Synechocystis sp. PCC 6803</span> <a itemprop="url" href="http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/taxonomy/1148"> <span itemprop="entryID">1148</span> </a> </span> </div> <!-- seeAlso --> <div style="display:none" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="seeAlso" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="isEntryOf" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase"> <span itemprop="name">NCBI Taxonomy</span> </span> <a itemprop="url" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/1148"> <span itemprop="entryID">1148</span> </a> </span> <span itemprop="seeAlso" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabaseEntry"> <span itemprop="isEntryOf" itemscope="" itemtype="http://schema.org/BiologicalDatabase"> <span itemprop="name">identifiers.org Taxonomy</span> </span>: <a itemprop="url" href="http://identifiers.org/taxonomy/1148"> <span itemprop="entryID">1148</span> </a> </span> </div>
Microdata Extractor によるパース結果
BiologicalDatabase_url=http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/taxonomy/taxonomy.owl BiologicalDatabase_name=DDBJ Taxonomy ontologies BiologicalDatabaseEntry_entryID=1148 BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_name=Synechocystis sp. PCC 6803 BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_url=http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/taxonomy/1148 BiologicalDatabaseEntry_taxon_BiologicalDatabaseEntry_entryID=1148 BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabase_name=NCBI Taxonomy BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabaseEntry_url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/1148 BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabaseEntry_entryID=1148 BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabase_name=identifiers.org Taxonomy BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabaseEntry_url=http://identifiers.org/taxonomy/1148 BiologicalDatabaseEntry_seeAlso_BiologicalDatabaseEntry_entryID=1148
RDFグラフの視覚化 Turtle, Microdata, JSON-LDで可視化
Sagaceウェブページ
コメント
- http://sagace.nibio.go.jp/press/metadata/markup/#entryID のmicrodata例に閉じたタグ</a>がない
- (isEntryOfでしょうか。)修正しました。
- http://sagace.nibio.go.jp/press/metadata/markup/#entryID のmicrodata例に閉じたタグ</a>がない