SPARQLthon117

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第117回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。参加予定の方は、このページ下部の「参加者」欄にご記名ください。 == 開催概要 == <!-- 今回は参加予定者数が限られていたこと、千葉県にも緊急事態宣言が発令されたこと、感染者数の増加などの状況に鑑み、オンライン開催とします。 新コロ情勢に鑑みオンライン開催を続けてきましたが、オンラインでは新しいコラボレーションやクリエイティブな議論は難しいことが分かってきたため、可能な限りオフライン開催に復帰していこうと思います（状況によりオンラインに戻る可能性あり、会場の様子をオンライン参加者用に中継する可能性あり）。 --> * 開催期間： 2022年6月23（木）- 24日（金） * 開催場所： DBCLS柏の葉 and オンライン（ハイブリッド開催）<!--<s>DBCLS柏の葉</s> 開催方法は未定（オンライン開催 or オフライン開催）--> <!-- ** 外部の方は1Fで検温のち、入館届(1Fと6Fに設置)に記入しDBCLSに提出してください ** 6Fの入り口に鍵がかかっている場合、入り口横の電話やSlackなどでお知らせください --> * 開催連絡： biohackathon-jpメーリングリスト、および SPARQLthon Slack の #announcements チャンネルを参照ください === オンラインツール === * [https://openid.dbcls.jp/ DBCLS OpenID] サイト上でアカウント作成可能（ですが、よく壊れているみたいなので遠慮なくご指摘ください） ** アカウント作成時の確認メールが誤判定されることが多いようなので迷惑メールフォルダもご確認ください（すみません…） * [http://groups.google.com/group/biohackathon-jp biohackathon-jpメーリングリスト] 誰でも参加可能なはずです * [https://join.slack.com/t/sparqlthon/shared_invite/zt-10dkhz490-ERm31oI8lmz9H0eEQbrgyw Slackの招待リンク] 1/14更新、無期限 * [https://pesto.app/team/sparqlthon/ca0l4x6y Pragliの招待リンク] 6/1更新、1ヶ月有効 (使い方 → [[SPARQLthon#Pragli]]) * [https://us04web.zoom.us/j/74629751197?pwd=9YIJyVZrpiyhOiDKQo5sZxXkACkXog.1 SPARQLthon Zoom] 6/24 更新 ** 定期ミーティングにし忘れていたので修正しました ログインできない、招待リンクの有効期限が切れている等なにか不具合がありましたらお手数ですが Slack や sparqlthon@biohackathon.org にご連絡ください。 == 参加手順 == * この Wiki ページの下の方にある「参加者」の欄に名前を追記する ** TogoWikiへのログイン・書き込みには DBCLS OpenID のアカウントが必要です * 2日目 17:00 までにスライドに進捗を記載してラップアップを行います (Zoomでも中継予定) ** [https://docs.google.com/presentation/d/1Q_mT35aFhXmD1FYRUNEvKRTtoU4riL1nMPyfiEiJRJw/edit?usp=sharing SPARQLthon117スライド] にテンプレートを用意しましたので適宜追加ください （参考： [https://docs.google.com/presentation/d/1V1Vrbo7JOBzLknCw9VOtMibzZfarn4CgNbbiwJCSJhY/edit?usp=sharing 116], [https://docs.google.com/presentation/d/1hPjxw8vgtexGarhBy0WpSON3cGFWbk368IEUSCVxSxs/edit?usp=sharing 115], [https://docs.google.com/presentation/d/1XlJeTLNDjnZ-bErHqNMM01XpWPyCMc0bajRRZtsPjBU/edit?usp=sharing 114], [https://docs.google.com/presentation/d/179lPyXnDP_P9hrqRgQABdNW_p1ny-_IF2gN2ioChhZY/edit?usp=sharing 113], [https://docs.google.com/presentation/d/1T6e31bf20fEqpJkFFEZqRRsLdkuGSMCnUHUG6k0i2e8/edit?usp=sharing 112], [https://docs.google.com/presentation/d/1_Q06duV3qWWcXM9755CB5xX61wV3fg-6nHLaQ2PdS90/edit?usp=sharing 111], [https://docs.google.com/presentation/d/1T-EMBcuVZMhFVQRX4lLENvCOXZUhAM-pA4J1FKSOqXo/edit?usp=sharing 110], [https://docs.google.com/presentation/d/1EdQBx4AqbsTtDvWNdy5o5CmDDWlZgOGQut1H5QwRR0s/edit?usp=sharing 109], [https://docs.google.com/presentation/d/18co656-KHKKxGpdqe9KsyiTAmcrREdhG_L4Ed9octdg/edit?usp=sharing 108], [https://docs.google.com/presentation/d/1meLszjje2n2yNyYbku5FH9L1eeUW6nf3k_dE1Jq1xrw/edit?usp=sharing 107], [https://docs.google.com/presentation/d/1P2RniuJtTLlcUfGT_18_mKb0-MiElCi843DBblmcgNM/edit?usp=sharing 106], [https://docs.google.com/presentation/d/1n15AqnH0bHRnahhUFyG6wHU0vBBMIoiQsE3mO7qJK00/edit?usp=sharing 105], [https://docs.google.com/presentation/d/1ujHnS-SOfwXkwQdSG2HSSg9T9qrN-yzbRQIs8mRNhIY/edit?usp=sharing 104], [https://docs.google.com/presentation/d/1WLOn6y_YRHijL7ctogm017K_wqRi1IT7m85SHFoCgl8/edit?usp=sharing 103], [https://docs.google.com/presentation/d/1MNTz0D3qZPuADfDrc78zgAPKjrMtE_11am3COs63sOk/edit?usp=sharing 102], [https://docs.google.com/presentation/d/1ImFD-RG9_ESgidjxlnGndkfIcuWTX2l6i4S8llwjT2k/edit?usp=sharing 101], [https://docs.google.com/presentation/d/1ImFD-RG9_ESgidjxlnGndkfIcuWTX2l6i4S8llwjT2k/edit?usp=sharing 100], [https://docs.google.com/presentation/d/1kySig2Pn7WyJqhWAhcX_wytJaarPR8pjlNXnmhU8XCA/edit?usp=sharing 99], [https://docs.google.com/presentation/d/18ZvrBy3pW2GnaTvCb0SnCFgloNdlzylDEphAREwZtlc/edit?usp=sharing 98], [https://docs.google.com/presentation/d/1kySig2Pn7WyJqhWAhcX_wytJaarPR8pjlNXnmhU8XCA/edit?usp=sharing 97], [https://docs.google.com/presentation/d/16S-1CGaPORgnvMs9FGYKY6K9cTVmObXHi9m2f8crfR8/edit?usp=sharing 96], [https://docs.google.com/presentation/d/14q6JoysbWRPf-P5Xb0GxZmaiJx_HGS9hOnJBOk8j_58/edit?usp=sharing 95], [https://docs.google.com/presentation/d/1-EU4hdvPeNWB3UUG-LXbQgduGiLadfSjPXW5EHiQRm0/edit?usp=sharing 94], [https://docs.google.com/presentation/d/1QyKFNeMPFTOysMtSenL6yW49iFf9vbSZX3mgTzR41z4/edit?usp=sharing 93], [https://docs.google.com/presentation/d/1Zg1cavg6ADZkKJceHL2ZsrjaDp740XdmPoJuMxb2MBU/edit?usp=sharing 92], [https://docs.google.com/presentation/d/1NSfNCIpKuACbEBYg8q6D6cj5ymBE8luNRKhZBDSYRN8/edit?usp=sharing 91]） === オンライン参加の場合 === ラップアップなど全員参加のものは Zoom で、各グループごとの打ち合わせなどは Pragli で行う予定です。 == プロジェクト == === TPP グループ全体 === ==== 新規 ==== [https://biosciencedbc.jp/news/20220401-03.html 2022年度新規採択研究開発課題] * SSBD: バイオイメージングデータのグローバルなデータ共有システムの構築 (大浪) * シスエレメントDB(仮): 細胞ごとの多様な活性やゲノム変異・多型との関連を探索できるシスエレメント・データベースの開発 (粕川） * KEGG MEDICUS: ヒトゲノム・病原体ゲノムと疾患・医薬品をつなぐ統合データベース (金久) * GlyCosmos Portal: 異分野融合を志向した糖鎖科学ポータルのデータ拡充と品質向上 (木下) * PDBj: 蛋白質構造データバンクのデータ駆動型研究基盤への拡張 (栗栖) * MicrobeDB.jp: マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指した微生物統合データベースの特化型開発 (森) ==== 継続中 ==== * 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/ * プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/ ==== 終了 ==== * [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/ * [/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下) - https://glycosmos.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/ * [https://research-er.jp/projects/view/965240 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合] (菅野) - http://kero.hgc.jp/ * [https://research-er.jp/projects/view/965235 エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充] (沖) - http://chip-atlas.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965236 ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース] (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/ * [[TPP-masuya|生命と環境のフェノーム統合データベース]] (桝屋) * [[TPP-arita|生物種メタボロームモデル・データベースの構築]] (有田) * [[TPP-tokunaga|個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース]] (徳永) * [[TPP-ishihama|プロテオーム統合データベース：jPOST]] (石濱) - http://jpostdb.org/ * [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪) === SPARQLthon グループ === 必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行） === 今後の予定 === 必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行） == 参考リンク == * これまでの [[SPARQLthon]] == 参加者 == * 片山俊明 (DBCLS) * 川島秀一 (DBCLS) * 守屋勇樹 (DBCLS) * 岡別府陽子 (OKBP) * 千葉啓和 (DBCLS) * 佐藤大輔 (Lifematics) * <s>山中遼太 (Oracle)</s> * Marlee Dijkman（PENQE）初日のみ * 行事光（PENQE）初日のみ * 永野朗夫（PENQE）初日のみ * 山田隼嗣（理研）23午後～24 * 内藤雄樹 (DBCLS) * 小野浩雅(DBCLS) * 高月照江(DBCLS) * 石井学(GAJ) * 山本泰智(DBCLS) * 池田秀也 (DBCLS) * 三橋信孝(DBCLS) * 大田達郎(DBCLS) 23のみ * 鐘ヶ江弘美(NARO) * 藤澤貴智（遺伝研） * 森宙史（遺伝研） * 仲里猛留（NITE）24のみ * 木下聖子（創価大）オンライン * 八尾宙大（創価大B4）オンライン * 田澤賢（アクシオヘリックス） * 鎌田真由美（京都大） * 小湊みのり（京都大）

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