SPARQLthon110

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第110回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。参加予定の方は、このページ下部の「参加者」欄にご記名ください。 == 開催概要 == * 開催期間： 2021年11月18（木）- 19日（金） * 開催場所： DBCLS柏の葉 ** 外部の方は1Fで検温のち、入館届(1Fと6Fに設置)に記入しDBCLSに提出してください ** 6Fの入り口に鍵がかかっている場合、入り口横の電話やSlackなどでお知らせください * 開催連絡： biohackathon-jpメーリングリスト、および SPARQLthon Slack の #announcements チャンネルを参照ください === オンラインツール === * [https://openid.dbcls.jp/ DBCLS OpenID] サイト上でアカウント作成可能（ですが、よく壊れているみたいなので遠慮なくご指摘ください） * [http://groups.google.com/group/biohackathon-jp biohackathon-jpメーリングリスト] 誰でも参加可能なはずです * [https://join.slack.com/t/sparqlthon/shared_invite/zt-yqpjn5eu-rfK~pm1YwR17L_16TZpCoQ Slackの招待リンク] 11/16更新、1ヶ月有効 * [https://pragli.com/team/sparqlthon/woaji7nu Pragliの招待リンク] 11/16更新、1ヶ月有効 (使い方 → [[SPARQLthon#Pragli]]) * [https://us04web.zoom.us/j/77180601091?pwd=d0Q5QUpta0FzbHNsQmFxVHBkRm5rdz09 SPARQLthon Zoom] 11/16確認 ログインできない、招待リンクの有効期限が切れている等なにか不具合がありましたらお手数ですが Slack や sparqlthon@biohackathon.org にご連絡ください。 == 参加手順 == * この Wiki ページの下の方にある「参加者」の欄に名前を追記する ** TogoWikiへのログイン・書き込みには DBCLS OpenID のアカウントが必要です * 2日目 17:00 までにスライドに進捗を記載してラップアップを行います (Zoomでも中継予定) ** [https://docs.google.com/presentation/d/1T-EMBcuVZMhFVQRX4lLENvCOXZUhAM-pA4J1FKSOqXo/edit?usp=sharing SPARQLthon110] スライド にテンプレートを用意しましたので適宜追加ください （参考： [https://docs.google.com/presentation/d/1EdQBx4AqbsTtDvWNdy5o5CmDDWlZgOGQut1H5QwRR0s/edit?usp=sharing 109], [https://docs.google.com/presentation/d/18co656-KHKKxGpdqe9KsyiTAmcrREdhG_L4Ed9octdg/edit?usp=sharing 108], [https://docs.google.com/presentation/d/1meLszjje2n2yNyYbku5FH9L1eeUW6nf3k_dE1Jq1xrw/edit?usp=sharing 107], [https://docs.google.com/presentation/d/1P2RniuJtTLlcUfGT_18_mKb0-MiElCi843DBblmcgNM/edit?usp=sharing 106] [https://docs.google.com/presentation/d/1n15AqnH0bHRnahhUFyG6wHU0vBBMIoiQsE3mO7qJK00/edit?usp=sharing 105] [https://docs.google.com/presentation/d/1ujHnS-SOfwXkwQdSG2HSSg9T9qrN-yzbRQIs8mRNhIY/edit?usp=sharing 104], [https://docs.google.com/presentation/d/1WLOn6y_YRHijL7ctogm017K_wqRi1IT7m85SHFoCgl8/edit?usp=sharing 103], [https://docs.google.com/presentation/d/1MNTz0D3qZPuADfDrc78zgAPKjrMtE_11am3COs63sOk/edit?usp=sharing 102], [https://docs.google.com/presentation/d/1ImFD-RG9_ESgidjxlnGndkfIcuWTX2l6i4S8llwjT2k/edit?usp=sharing 101], [https://docs.google.com/presentation/d/1ImFD-RG9_ESgidjxlnGndkfIcuWTX2l6i4S8llwjT2k/edit?usp=sharing 100], [https://docs.google.com/presentation/d/1kySig2Pn7WyJqhWAhcX_wytJaarPR8pjlNXnmhU8XCA/edit?usp=sharing 99], [https://docs.google.com/presentation/d/18ZvrBy3pW2GnaTvCb0SnCFgloNdlzylDEphAREwZtlc/edit?usp=sharing 98], [https://docs.google.com/presentation/d/1kySig2Pn7WyJqhWAhcX_wytJaarPR8pjlNXnmhU8XCA/edit?usp=sharing 97], [https://docs.google.com/presentation/d/16S-1CGaPORgnvMs9FGYKY6K9cTVmObXHi9m2f8crfR8/edit?usp=sharing 96], [https://docs.google.com/presentation/d/14q6JoysbWRPf-P5Xb0GxZmaiJx_HGS9hOnJBOk8j_58/edit?usp=sharing 95], [https://docs.google.com/presentation/d/1-EU4hdvPeNWB3UUG-LXbQgduGiLadfSjPXW5EHiQRm0/edit?usp=sharing 94], [https://docs.google.com/presentation/d/1QyKFNeMPFTOysMtSenL6yW49iFf9vbSZX3mgTzR41z4/edit?usp=sharing 93], [https://docs.google.com/presentation/d/1Zg1cavg6ADZkKJceHL2ZsrjaDp740XdmPoJuMxb2MBU/edit?usp=sharing 92], [https://docs.google.com/presentation/d/1NSfNCIpKuACbEBYg8q6D6cj5ymBE8luNRKhZBDSYRN8/edit?usp=sharing 91]） === オンライン参加の場合 === ラップアップなど全員参加のものは Zoom で、各グループごとの打ち合わせなどは Slack や Pragli で行う予定です。 == プロジェクト == === TPP グループ全体 === ==== 継続中 ==== * [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/ * [/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下) - https://glycosmos.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/ * [https://research-er.jp/projects/view/965240 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合] (菅野) - http://kero.hgc.jp/ * [https://research-er.jp/projects/view/965235 エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充] (沖) - http://chip-atlas.org/ * [https://research-er.jp/projects/view/965236 ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース] (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/ * 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/ * プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化（石濱）- https://jpostdb.org/ ==== 終了 ==== * [[TPP-masuya|生命と環境のフェノーム統合データベース]] (桝屋) * [[TPP-arita|生物種メタボロームモデル・データベースの構築]] (有田) * [[TPP-tokunaga|個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース]] (徳永) * [[TPP-ishihama|プロテオーム統合データベース：jPOST]] (石濱) - http://jpostdb.org/ * [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪) === SPARQLthon グループ === 必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行） * /mw/SPARQLthon の説明文、そろそろアップデートが必要ではないかな === 今後の予定 === 必要に応じて追記ください（→ 進捗報告は Google slides に移行） == 参考リンク == * これまでの [[SPARQLthon]] == 参加者 == * 片山俊明 (DBCLS) * 川島秀一 (DBCLS) * 守屋勇樹 (DBCLS) * 坊農秀雅 (広大/DBCLS、18日のみ） * 岡別府陽子 (OKBP) * Marleen Dijkman（PENQE）18日のみ * 永野朗夫（PENQE）18日のみ * 鐘ケ江弘美（NARO）18日のみ * 大石直哉（DOGRUN） * <span style="text-decoration: line-through;">大田達郎（DBCLS）2日目のみ</span> 両日欠席になりました * 山中遼太（Oracle）<span style="text-decoration: line-through;">両日とも午後のみ</span> 終日 * 鈴木貴之 （広大） * 高月照江 (DBCLS) * 山本泰智 (DBCLS) * 千葉啓和 (DBCLS) * 福島敦史 (理研CSRS、19日のみ) * 佐藤大輔 (Lifematics) * 内藤雄樹 (DBCLS) * 藤澤貴智（遺伝研）

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