BodyParts3D/Anatomography

提供：TogoWiki

2010年10月21日 (木) 04:17時点における最新版

BodyParts3D/Anatomographyとは

BodyParts3D(ボディパーツ3D)は人体各部位の位置や形状を3次元モデルで記述したデータベースです。Anatomography(アナトモグラフィー)を使って、BodyParts3Dから解剖学用語を選択して自由に人体のモデル図を作成できます。

BodyParts3D/Anatomographyの場所

• 統合データベースプロジェクトの「ツール＆解析サービス」から。
• トップページURL (http://lifesciencedb.jp/bp3d)
• 「BodyParts3D or Anatomography or アナトモグラフィー」でgoogle検索

【実習１】基本的な操作手順を覚える

• 「Information」タブ→「ユーザガイド」→「Getting Started」をひと通り実施します。

【実習２】Web API（デモ版）を使う

• Anatomography Web APIのページ

【実習３】AQP3遺伝子の臓器別発現量を人体ヒートマップで表示し発現状況を可視化する

• アクアポリン３(AQP3)という遺伝子の発現量ヒートマップを作成します。
  • データソース：BioGPS(http://bipgps.gnf.org)

• まだ、csvデータを直接取り込むインタフェースがありませんので、作成済みマップのリンクをクリックしてください。→作製済みマップ (レスポンスが遅い場合は｢作成済み画像｣をクリックしてください)
• 「臓器別に取得された数値を色情報に変換してヒートマップを作成するには」を参考に、発現量を入力できることを確認します。
• 「Palletの中で選択した臓器にフォーカスするには」を参考に、画像を見やすい大きさにします。

【実習４】BodyParts3D人体の特徴を確認する

• モデル人体の身長を調べる
  • 確認方法
    • ｢Bp3dViewer｣で｢人体｣アイコンをPalletにドラッグして、Palletに表示されるZmax(1670.79mm)とZmin(-13.5285mm)の値を確認。その値から168.4cm程度。

• 左右の腎臓の高さを比較する
  • 確認方法（直感的）：
    • 腎臓をAnatomographyで表示(レスポンスが遅い場合は｢作成済み画像｣をクリックしてください)
  • 確認方法（数値的）：
    • 確認方法（直感的）で作成したAnatomographyのPalletには｢腎臓｣だけがあり、｢左腎臓｣、｢右腎臓｣がないため、それぞれの高さは分からない。そこで、
    • 画面上で｢左腎臓｣をクリック後、｢Pick｣タブに表示された｢左腎臓｣のチェックボックスをチェックし、Palletに追加して、Zmax(1117.5699mm)を確認
    • ｢右腎臓｣についても同様の方法でZmax(1101.8199mm)を確認。

• 右冠状動脈が上行大動脈の右大動脈洞から起こる
  • 確認方法：
    • Anatomographyで表示(レスポンスが遅い場合は｢作成済み画像｣をクリックしてください)
    • ｢上行大動脈｣、｢右冠状動脈｣、｢心臓｣のアイコンが探しにくい場合は、画面左上の｢Data search｣で臓器名を入力して検索できます。

• 右肺が左肺よりも大きいことを確認
  • 右肺と左肺の体積を表示
  • Anatomographyで表示して確認 (レスポンスが遅い場合は｢作成済み画像｣をクリックしてください)

※現段階ではBodyParts3Dで観測できる全ての特徴が解剖学的に正しいとは限りませんので、正確には書籍等で確認してください。BodyParts3D作成過程を説明したモデリングノートも参照ください

紹介資料

• 統合TV
  • BodyParts3D/Anatomography の使い方 ～変更点の紹介編～
  • BodyParts3D/Anatomography の使い方 ～操作編～
• YouTube投稿動画(英語、1min30sec)
• プレゼン資料