BH16.12/TogoGenome

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* TogoGenome でゲノム弁当の食材が網羅されていなかった件 * 外部データベースのIDやキーワードからTogoGenomeの遺伝子や生物種に辿りつけない == バイオメディカル応用 == * ヒトの遺伝子・変異解析につながるデータベースシステム整備 * メディカル系のデータベースのRDF化 * 変異情報の集積、表示、解析 * 表現型情報へのリンク == 比較ゲノム == * ヒトを中心に遺伝子とその前後配列単位で種間アラインメント → MBGD, KEGG OC など, vg * アミノ酸配列と塩基配列のアラインメント → jPOST, PDBj, DDBJ == エンドポイント == * http://togogenome.org/sparql-test ** UniProt 2015_05 ** RefSeq 69 * http://dev.togogenome.org/sparql-test ** UniProt 2016_01 ** RefSeq 74 * http://ep.dbcls.jp/sparql-import ** UniProt 2016_09 ** RefSeq 78 dev を最新版に置き換えた時に問題になるスタンザ * TBD JBrowse の exon/intron をなんとかする

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