BH12.12/糖鎖オントロジー

提供：TogoWiki

2012年12月27日 (木) 11:01時点における最新版

• 糖鎖オントロジー
  • https://github.com/JervenBolleman/Glycan.rdf/blob/master/glycan.ttl
• 論文を書かないとKiyokoさんに怒られます

• 糖鎖のユニーク文字列化：曖昧な構造も表現できる新しい糖鎖表記法の開発

BH12で開発したアルゴリズムのコード化＆改良

単糖のC-1位の取得テスト（JMSDB,PDB)

還元化単糖について、C-1の取得が難しい

既存の表記法との相互変換において、C-1問題を対応する予定

InChIKeyに相当するWURCSKeyをWURCSからハッシュ関数を利用して生成し、URIに利用できないか検討する。

URIについては、後日議論する。