BH12.12/stanza titech/taxonomic composition sample

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==taxonomic composition（サンプル）== *スタンザ概要-------------------------- *:あるSRSサンプルの系統組成 *入力---------------------------------- *:SRS_ID *出力---------------------------------- <table border="1"> <tr> <th>変数名</th><th>説明</th><th>URI or literal</th> </tr> <tr> <td>?taxon_label</td><td>系統名</td><td>literal</td> </tr> <tr> <td>?organismCount</td><td>相対存在量</td><td>literal(double型)</td> </tr> </table> *使用グラフ---------------------------- :*<http://microbedb.jp/meta16S_env/> :*<http://microbedb.jp/ncbitaxon/> :*<http://microbedb.jp/meo/> :*<http://microbedb.jp/srs/> *メモ---------------------------------- :系統階層によって、predicateを変える :MEO_0000431 : Genus :MEO_0000432 : Family :MEO_0000433 : Order :MEO_0000434 : Class :MEO_0000435 : Phylum :MEO_0000436 : Domain *SPARQL query-------------------------- 例：SRS334046の系統組成 <pre> PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> PREFIX srs: <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/> PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/> SELECT ?taxon_label ?organismCount FROM <http://microbedb.jp/meta16S_env/> FROM <http://microbedb.jp/ncbitaxon/> FROM <http://microbedb.jp/meo/> FROM <http://microbedb.jp/srs/> WHERE{ srs:SRS334046 meo:MEO_0000429 [ meo:MEO_0000434 ?ncbitaxon; #分類によってpredicateを変える meo:MEO_0000430 ?organismCount; ]. ?ncbitaxon rdfs:label ?taxon_label. }ORDER BY DESC(?organismCount) </pre>

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