BH12.12/stanza titech/taxon general
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Taxon General
- スタンザ概要--------------------------
- ある系統に関する基本情報のスタンザ
- 入力----------------------------------
- NCBI Taxon ID
- 出力----------------------------------
| 変数名 | 説明 | URI or literal |
|---|---|---|
| ?ncbitaxon_id | NCBI Taxon ID | URI |
| ?ncbitaxon_label | NCBI Taxon名 | literal |
| ?ncbitaxon_rank | タクソン名 | URI |
| ?ncbitaxon_superclass | 親クラス | URI |
| ?dbxref | literal |
- 使用グラフ----------------------------
- ncbitaxon.owl
- メモ----------------------------------
- SPARQL query--------------------------
例：NCBITaxon_584626に関する情報
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX srs: <http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?sample=>
PREFIX envo: <http://purl.bioontology.org/ontology/ENVO/>
PREFIX gaz: <http://purl.org/obo/owl/GAZ#>
PREFIX fma: <http://sig.uw.edu/fma#>
PREFIX dc: <http://purl.org/dc/elements/1.1/>
PREFIX ncbitaxon: <http://purl.org/obo/owl/NCBITaxon#>
PREFIX meo: <http://purl.jp/bio/11/meo/>
PREFIX rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX go: <http://www.geneontology.org/formats/oboInOwl#>
SELECT ?ncbitaxon_id ?ncbitaxon_label ?ncbitaxon_rank ?ncbitaxon_superclass ?dbxref
WHERE{
ncbitaxon:NCBITaxon_584626 rdfs:label ?ncbitaxon_label.
?ncbitaxon_id rdfs:label ?ncbitaxon_label.
OPTIONAL{
?ncbitaxon_id go:hasDbXref/rdfs:label ?dbxref.
}
OPTIONAL{
?ncbitaxon_id <has_rank> ?ncbitaxon_rank.
}
OPTIONAL{
?ncbitaxon_id rdfs:subClassOf ?ncbitaxon_superclass.
}
}
