BH12.12/stanza titech/Disease Information

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Disease Information

• スタンザ概要--------------------------

  ある病気の基本情報を取得

• 入力----------------------------------

  PDO ID

• 出力----------------------------------

変数名	説明	URI or literal
?diseaseName	病名	literal
?synonymList	同義語のリスト	literal
?def	病気の定義	literal
?class	病気のクラス	literal
?symptomList	症状のリスト	literal

• 使用グラフ----------------------------

  PDO_ver0.2.owl

  CSSO_ver0.1.owl

  mapping_ver2.ttl

• メモ----------------------------------
• SPARQL query--------------------------

例：Myocarditis（pdo:PDO_000173）に関する情報

PREFIX pdo: <http://purl.jp/bio/11/pdo/> 
PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX csso: <http://purl.jp/bio/11/csso/> 

SELECT ?diseaseName  ?synonymList  ?def  ?class ?symptomList
FROM <http://localhost:8890/PDO/test/PDO_ver0.2.owl>
FROM <http://localhost:8890/PDO/test/CSSO_ver0.1.owl>
FROM <http://localhost:8890/PDO/test/mapping_ver2.ttl>

WHERE 
{
	pdo:PDO_000173	rdfs:label	?diseaseName.
	{
		SELECT (GROUP_CONCAT(?synonym; SEPARATOR = " , ") AS ?synonymList)
			WHERE{
				pdo:PDO_000173	skos:altLabel	?synonym.
			}
	}
	{
		SELECT  (GROUP_CONCAT(?symptoms; SEPARATOR = " , ") AS ?symptomList)
			WHERE{
				pdo:PDO_000173	pdo:hasSymptomOf	?symptom.
				?symptom	rdfs:label	?symptoms.
			}
	}
	OPTIONAL{
		pdo:PDO_000173	obo:IAO_0000115	?def.
	}
	OPTIONAL{
		pdo:PDO_000173	rdfs:subClassOf+	?upperClass.
		?upperClass rdfs:subClassOf pdo:PDO_000001.
		?upperClass	rdfs:label	?class.
	}
}

実行結果