BH12.12/cc

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化合物グループ

目次 1 ルール 2 Standardの確認 3 例[1] 4 問題点 5 参考

ルール

化学構造が明らかな場合について

• 化合物のRDF,DBには、IUPACの IUPAC International Chemical Identifie(InChI)とInChIKeyを割り当てる。
• バージョンが幾つかあるので、Std. InChIおよびStd. InChIKeyを利用する。

Standardの確認

• InChIの場合："InChI=1S/"が文字列の最初にあります。
• InChIKeyの場合：BBBBBBBBBBBBBB-CCCCCCCCSA-N

InChIKey

27文字

InChIKey種類

S:standard InChIKey

N:non-standard InChIKey

InChIバージョン

A:1

B:2

例[1]

2-Amino-2-deoxy-4-O-β-D-galactopyranosyl-D-glucose

• Std. InChI:

InChI=1S/C12H23NO10/c13-4(1-14)7(18)11(5(17)2-15)23-12-10(21)9(20)8(19)6(3-16)22-12/h1,4-12,15-21H,2-3,13H2/t4-,5+,6+,7+,8-,9-,10+,11+,12-/m0/s1

• Std. InChIKey:

LAVNEPYDFKGEOD-JVCRWLNRSA-N

問題点

• 自由に利用できるユニークな化合物IDを格納した 化合物統合データベース がない。

参考

• IUPAC/InChI[2]
• InChI Software Downloads[3]

• Tautomer Identification and Tautomer Structure Generation Based on the InChI Code[4]

• New Benchmark for Chemical Nomenclature Software[5]

• 実務者連絡会　化合物オントロジー検討会議　議事録[6]

• chemspider[7]

• dbpedia-owl:inchi[8]

• InChIKey support in identifiers.org -> identifiers.org/inchikey/[9] 参照元

• InChIKey collision resistance: an experimental testing[10]