BH12.12/SPARQLthon7/GOLD MPO
提供:TogoWiki
(版間での差分)
28行: | 28行: | ||
|} | |} | ||
- | == Sample 情報LOD化の検討 | + | == Sample 情報LOD化の検討 == |
* MCLでは、Sample 情報を記述する語彙が準備されているので、その構造を検討した | * MCLでは、Sample 情報を記述する語彙が準備されているので、その構造を検討した |
2013年4月18日 (木) 08:20時点における最新版
MPO (Microbial Phonetype Ontology) 現状
- 2013/4/18 現在、クラスとプロパティあわせて、158ターム。
- BioPortal に、MPO v3 alpha として登録済。
GOLD 表現型情報のLOD化 現状
表現型 | トリプル数 |
---|---|
Cell shape | 18,036 |
Cell arrangement | 14,724 |
Oxygen requirement | 17,946 |
Motility | 16,782 |
pH | 2,106 |
Temperature range classification | 20,106 |
Temperature | 9,882 |
Salinity | 660 |
Energy source | 7,686 |
Sample 情報LOD化の検討
- MCLでは、Sample 情報を記述する語彙が準備されているので、その構造を検討した
- GCM minimum data sets, BioSample, MIGS などとの対応を見て、どのようにオントロジーを構築したらよいか?