BH12.12/SPARQLthon4/MBGD

提供：TogoWiki

2015年6月28日 (日) 19:22時点における最新版

SPARQLthon4

エンドポイントの使い分け

• 更新作業用エンドポイント
  • http://mbgd.genome.ad.jp:8047/sparql
• 更新が終了したら以下にデータをコピーする
  • http://sparql.nibb.ac.jp/sparql

大規模データへの対応

ファイル毎のロード時間

• バージョン番号(release-date)は、必要な場合にだけURIに含めるようにした
• 様々な生物種セットに関するオーソログ情報
  • 147ファイルを作成
    • dclst形式 → Turtle へ変換
  • Virtuosoにロード
    • 147ファイル、49Mトリプルで、約1時間
    • 1Mトリプルあたり、約73秒

• Virtuoso Tips
  • 大規模データの取り扱い（参照）
  • テキスト検索用インデックスの作成（参照）