TPP-masuya

提供:TogoWiki

(版間での差分)
移動: 案内, 検索
(ページの作成:「{| class="wikitable" | width="20%" | 研究開発課題名 || 生命と環境のフェノーム統合データベース |- | 研究代表者 || 桝屋 啓志 |- | 所属...」)
8行: 8行:
| 概   要 || 遺伝子の多様性の結果として現れる生命の表現型(フェノタイプ)の情報を、モデル動物(マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、メダカ)、ゲノム編集研究など、幅広い研究コミュニティから収集し、研究分野の垣根を超えて標準化・統合化・体系化してオープンに公開する。集約されたフェノタイプ情報は、ゲノム情報や分子情報とともに横断的に利活用することで、新たな生命科学イノベーションの原動力となると期待される。
| 概   要 || 遺伝子の多様性の結果として現れる生命の表現型(フェノタイプ)の情報を、モデル動物(マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、メダカ)、ゲノム編集研究など、幅広い研究コミュニティから収集し、研究分野の垣根を超えて標準化・統合化・体系化してオープンに公開する。集約されたフェノタイプ情報は、ゲノム情報や分子情報とともに横断的に利活用することで、新たな生命科学イノベーションの原動力となると期待される。
|}
|}
 +
 +
== 参加メンバー ==
 +
 +
* 桝屋 啓志 (理研)
 +
* :
 +
 +
== 検討課題 ==
 +
 +
* フェノーム統合データベースの構築
 +
* 各生物種ごとにフォーマットや表現方法がバラバラな表現型を RDF で統一化する
 +
* 表現型のデータ(疾患・検査結果・遺伝子発現など)
 +
** 数+単位の RDF 化
 +
* 生物(サンプル・バイオリソースなど)
 +
** 文献情報などリンク先の調査
 +
 +
== SPARQLthon ==
 +
 +
* [[SPARQLthon21]]
 +
* [[SPARQLthon20]]

2014年6月18日 (水) 05:18時点における版

研究開発課題名 生命と環境のフェノーム統合データベース
研究代表者 桝屋 啓志
所属・役職 理化学研究所 バイオリソースセンター ユニットリーダー
概   要 遺伝子の多様性の結果として現れる生命の表現型(フェノタイプ)の情報を、モデル動物(マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、メダカ)、ゲノム編集研究など、幅広い研究コミュニティから収集し、研究分野の垣根を超えて標準化・統合化・体系化してオープンに公開する。集約されたフェノタイプ情報は、ゲノム情報や分子情報とともに横断的に利活用することで、新たな生命科学イノベーションの原動力となると期待される。

参加メンバー

  • 桝屋 啓志 (理研)
  •  :

検討課題

  • フェノーム統合データベースの構築
  • 各生物種ごとにフォーマットや表現方法がバラバラな表現型を RDF で統一化する
  • 表現型のデータ(疾患・検査結果・遺伝子発現など)
    • 数+単位の RDF 化
  • 生物(サンプル・バイオリソースなど)
    • 文献情報などリンク先の調査

SPARQLthon

個人用ツール