SPARQLthon87
提供:TogoWiki
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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/ | * [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/ | ||
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* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下) | * [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下) | ||
** GlyCosmos GlycoGene https://glycosmos.org/ggdbs/index , GlyCosmos SPARQList https://sparqlist.glycosmos.org/sparqlist/ | ** GlyCosmos GlycoGene https://glycosmos.org/ggdbs/index , GlyCosmos SPARQList https://sparqlist.glycosmos.org/sparqlist/ |
2019年12月24日 (火) 08:40時点における版
第87回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。
目次 |
開催概要
- 開催期間:2019年 12月 23(月)- 24日(火)
- 開催場所:ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) @ 東京大学 柏の葉キャンパス駅前 サテライト 6階
- アクセス:http://dbcls.rois.ac.jp/access
- 開催連絡:http://groups.google.com/group/biohackathon-jp メーリングリストにて
- 周辺の食事処 Google Map
プロジェクト
TPP グループ全体
継続中
- データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発 (黒川) - http://microbedb.jp/
- 本番環境の再構築(藤澤)
- 糖鎖科学ポータルの構築 (木下)
- GlyCosmos GlycoGene https://glycosmos.org/ggdbs/index , GlyCosmos SPARQList https://sparqlist.glycosmos.org/sparqlist/
- . GGDB SPARQL endpoint https://sparql.glycoinfo.org/sparql
- GlyCosmos GlycoGene https://glycosmos.org/ggdbs/index , GlyCosmos SPARQList https://sparqlist.glycosmos.org/sparqlist/
- 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化 (栗栖) - http://pdbj.org/
- 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築 (田畑) - http://pgdbj.jp/
- 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈を目指した多階層オーミクスデータの統合 (菅野) - http://kero.hgc.jp/
- エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 (沖) - http://chip-atlas.org/
- ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
- 物質循環を考慮したメタボロミクス情報基盤 (有田) - http://www.massbank.jp/
- プロテオームデータベースの機能深化と連携基盤強化(石濱)- https://jpostdb.org/
- サーバー入れ替えによる新サーバーの環境構築(守屋)
終了
- 生命と環境のフェノーム統合データベース (桝屋)
- 生物種メタボロームモデル・データベースの構築 (有田)
- 個別化医療に向けたヒトゲノムバリエーションデータベース (徳永)
- プロテオーム統合データベース:jPOST (石濱) - http://jpostdb.org/
- 生命動態システム科学のデータベースの統合化 (大浪)
SPARQLthon グループ
- SPARQL support: Endpoint browser 開発版(守屋)
- TogoDB (dev → 本番環境へ) の移行準備 (片山・西澤)
- 切り替えまでに必要な残作業
- 9月以降のDBを引き継ぎ
- OWLIM から GraphDB への更新
- ドキュメント整備
- バグ修正
- 切り替えまでに必要な残作業
今後の予定
参考リンク
- これまでの SPARQLthon
参加者
- 片山俊明 (DBCLS)
- 川島秀一 (DBCLS)
- 坊農秀雅 (DBCLS) 初日のみ
- 内藤雄樹 (DBCLS) 初日のみ
- 吉沢明康 (京大・薬/Mass++ユーザー会)
- 村瀬雅樹 (Mass++ユーザー会)
- 岡別府陽子(OKBP)
- 永野朗夫 (PENQE) 24日15時まで
- 平原麗夏 (PENQE)
- 浅野由衣 (PENQE)
- 黒須亮平 (PENQE) 初日のみ
- 高月照江 (DBCLS)
- 山田一作(野口研究所)
- 守屋勇樹 (DBCLS)
- 畠中秀樹 (DBCLS)
- 小野浩雅(DBCLS)
- 大石直哉(dogrun)
- 仲里猛留(DBCLS)
- 大田達郎 (DBCLS) 2日目のみ
- 千葉啓和 (DBCLS)
- 池田秀也 (DBCLS)
- 仁宮洸太 (東大薬)
- 藤原豊史 (DBCLS)
- 山田涼太 (fuku)
- 知田悠生 (fuku)
- 建石由佳 (NBDC) 初日のみ
- 桝屋啓志(理研BRC)
- 櫛田達矢(理研BRC)
- 藤澤貴智(NIG)
- 福島敦史(理研CSRS)初日のみ
- Andrea Ghelfi (かずさDNA研)
- 佐藤大輔 (Lifematics)
- 平川英樹(かずさDNA研)
- 山口敦子 (DBCLS)
- 田中聡 (Trans-IT / Mass++ユーザー会)
- 鐘ケ江弘美 (NARO)
- 大石直哉 (DOGRUN)初日のみ
- 三橋信孝(NBDC)初日のみ
- 豊岡理人(NBDC)初日のみ
- 門間則和 (日立)
- 申在紋 (DBCLS)