SPARQLthon82

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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
** MicrobeDB.jp新サーバのセキュリティ検査・対応と外部公開申請をした (森)
** MicrobeDB.jp新サーバのセキュリティ検査・対応と外部公開申請をした (森)
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** トーゴーの日の要旨を書いてsubmitした (森) (明日24時締め切り)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
** [https://github.com/AtomGraph/CSV2RDF CSV2RDF] を利用して、[https://data.glygen.org/ GlyGen]のCSVデータを[https://docs.google.com/document/d/1f0jxhLhZ9Tw0QeaUrsINgUUsHtqZ7AlFy75Bx6ymtik/ RDFに変換]してみた。(山田)
** [https://github.com/AtomGraph/CSV2RDF CSV2RDF] を利用して、[https://data.glygen.org/ GlyGen]のCSVデータを[https://docs.google.com/document/d/1f0jxhLhZ9Tw0QeaUrsINgUUsHtqZ7AlFy75Bx6ymtik/ RDFに変換]してみた。(山田)

2019年7月30日 (火) 08:04時点における版

第82回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

  • 開催期間:2019年 7月 29(月)- 30日(火)
  • 開催場所:遺伝学研究所 生命情報研究センター棟 (DDBJ棟) 4F会議室 (W403-405)
  • アクセス:http://dbcls.rois.ac.jp/access
    • 遺伝研行きのシャトルバスがあります。乗り口は北口から出てロータリー向かって左手です。
    • 新幹線ーNIGシャトルバス接続情報
    • 9:30出発のシャトルバスに乗ってお越しいただくと、DDBJ棟までご案内します。
      • 関東方面からお越しの方は こだま639号 (東京8:26発、品川8:34発) がスムーズです。
      • 関西方面からお越しの方は こだま632号 (名古屋7:29発) がスムーズですが、朝が早いので前泊する方が楽です。
  • お昼について
    • 所内には小さい食堂がありますが、売店などはありません。お弁当などをお持ち頂くことをお勧めします。
  • ホテルについて

スケジュール

  • 7/29 (月)
    • 10:00-17:00 開発
    • 17:00- ラップアップ
    • 18:30- 懇親会 (希望者)
    • 20:25 遺伝研発三島行き最終シャトルバス
  • 7/30 (火)
    • 10:00-17:00 開発
    • 17:00-18:00 ラップアップ
    • 18:25, 19:25, 20:25 遺伝研発三島行きシャトルバス

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

終了

SPARQLthon グループ

  • 参考 CSV2RDF tweet
  • 微生物データを入れるSIP側システムについて(畠中・宗像・藤澤・森)
  • Google Dataset SearchにIntegbio DBカタログを入れるためのmicrodataの修正(畠中)
  • PubCaseFinder RDF (申,山口,藤原)
    • Biotea等を参考に文献周りのRDFのスキーマを大きく変更した.
    • 新しいスキーマでデータ作成中

今後の予定

参考リンク

参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 岡別府陽子(OKBP)
  • 山本泰智 (DBCLS)
  • 坊農秀雅 (DBCLS)
  • 横井翔 (NARO)
  • 小野浩雅 (DBCLS)
  • 仲里猛留 (DBCLS)
  • 内藤雄樹 (DBCLS)
  • 池田秀也 (DBCLS)
  • 大田達郎 (DBCLS)
  • 高月照江 (DBCLS)
  • 山口敦子 (DBCLS)
  • 千葉啓和 (DBCLS)
  • 畠中秀樹 (DBCLS)
  • 永野朗夫(PENQE)
  • 平原麗夏(PENQE)初日のみ
  • 浅野由衣(PENQE)
  • 森宙史(遺伝研)
  • 藤原豊史 (DBCLS)
  • 小林紀郎 (RIKEN)
  • 福島敦史 (RIKEN)
  • 高橋みき子 (RIKEN)
  • 鐘ケ江弘美 (NARO)
  • 藤澤貴智(遺伝研)
  • 大石直哉(DOGRUN)
  • 佐藤大輔 (Lifematics)
  • 平木愛子 (DBCLS) 30日のみ
  • 田中聡 (Trans-IT)
  • 山田一作(野口研)29日のみ
  • 川本祥子(遺伝研)
  • 桂樹哲雄(NARO)
  • 建石由佳(NBDC)
個人用ツール