SPARQLthon79

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* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
** WURCSから、糖鎖構造のイメージのRDF化するバッチの開発。base64の文字列を、sparqletでエンドポイントにロード。(青木・新町)
** WURCSから、糖鎖構造のイメージのRDF化するバッチの開発。base64の文字列を、sparqletでエンドポイントにロード。(青木・新町)
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*** http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/SPARQList/glyco
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/

2019年4月23日 (火) 08:28時点における版

第79回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

終了

SIPグループ

  • CultureCollectionRDF (川島)
  • カイコRefEx(坊農、横井)
  • 菌株(NBRC/JCM)RDFのスキーマ調整(川島、高月、市川、波平、岡別府)
  • TOGOVar Rice (仮) (川島、川本、畠中、岡別府、鐘ケ江、稲富、桂樹)

SPARQLthon グループ

  • KEGG OC、UniProt 経由で類似配列のアノテーションをまとめて取ってくる(守屋)
    • virtuoso の property path バグに悩ませられる ->

今後の予定

  • 7/7-12 国内版バイオハッカソン BH19.7
    • 5/7-8 BH19.7会場打ち合わせ
  • 8/31-9/7 国際版BioHackathon BH19
    • 4/25-26 BH19会場打ち合わせ
  • 11/18-22 2nd ELIXIR BioHackathon
    • 5/1 notification / registration open

参考リンク

参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 守屋勇樹 (DBCLS)
  • 永野朗夫 (PENQE)
  • 平原麗夏 (PENQE) 初日のみ
  • 浅野由衣 (PENQE) 初日のみ
  • 吉沢明康 (京都大学)
  • 山田一作 (公益財団法人野口研究所) 初日:10:30まで、二日目:終日 11時頃〜
  • 岡別府陽子 (OKBP)
  • 藤原豊史 (DBCLS)
  • 千葉啓和 (DBCLS)
  • 坊農秀雅 (DBCLS)
  • 多湖真一郎 (富士通研) 22日のみ
  • 横井翔 (農研機構)
  • 市原寿子 (大阪大学) 22日のみ
  • 沖 真弥 (九州大学)
  • 鐘ケ江弘美 (農研機構)
  • 稲富素子 (農研機構)
  • 桂樹哲雄 (農研機構) 初日:終日、二日目:14時過ぎから
  • 小野浩雅 (DBCLS)
  • 仲里猛留 (DBCLS) 22日のみ
  • 内藤雄樹 (DBCLS)
  • 池田秀也 (DBCLS)
  • 五斗進 (DBCLS) 22日は14時頃まで
  • Andrea Ghelfi (かずさDNA研) 23日のみ
  • 川本祥子 (DBCLS/NIG) 23日のみ
  • 藤澤貴智(遺伝研)22日のみ
  • 新町大輔 (SparqLite) 23日のみ
  • 青木信行 (SparqLite) 23日のみ
  • 高月照江(DBCLS)
  • 畠中秀樹(DBCLS)
  • 山本泰智(DBCLS)22日リモート
  • 大石直哉(DOGRUN)
  • 建石由佳(NBDC)22日のみ
  • 藤原豊史(DBCLS)
  • 平川英樹(かずさ)23日のみ
  • 佐藤大輔(Lifematics)
個人用ツール