SPARQLthon72

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==== 継続中 ====
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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
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** ミヤコグサのゲノムRDFにMBGD cluster ID情報を追加するためのRDFを作成(藤澤)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
** total glycomeデータベース (三浦)UIの修正・改良
** total glycomeデータベース (三浦)UIの修正・改良
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* [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪)
* [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪)
=== SPARQLthon グループ ===
=== SPARQLthon グループ ===
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* Virtuoso 7.2.5.1をインストール, 試してみた (千葉)
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* Virtuoso 7.2.5.1をインストール (千葉)
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** ロード: 14.3 M triples/min (並列化なし)
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** とりあえず taxonomy.ttl をロードしてみた: 14.3 M triples/min (並列化なし)
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** isqlでグラフ一覧を取得するのが遅い
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* BioSample とかで DB 間のリンクを表すオントロジー(プロパティ)がほしい (大田)
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** Identifiers.org 用のオントロジー作成中なので property が少なければこちらに追加ということでも (片山)
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** https://gist.github.com/ktym/e2fcac66b187abbd6767245dcb1b2752
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** ちなみに [https://www.genome.jp/linkdb/ LinkDB] では equivalent, original, reverse, indirect の4つ
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* TogoGenome テキスト検索の見直し (片山・岡別府)
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* TogoVar 開発計画 (片山・川島)
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* BH18 ポスター等うちあわせ (永野・片山)
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* BH18 ビール醸造計画
=== 今後の予定 ===
=== 今後の予定 ===
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* 山田一作(野口研究所)27日13時まで、28日16時まで
* 山田一作(野口研究所)27日13時まで、28日16時まで
* 佐藤大輔(Lifematics)27日午後から
* 佐藤大輔(Lifematics)27日午後から
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* 建石由佳(NBDC)28日のみ
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* 藤澤貴智(遺伝研)

2018年9月28日 (金) 13:42時点における最新版

第72回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

現在、当 wiki と OpenID サーバの承認連携に問題が発生しています。過去に OpenID を使ってログインしたことがある方は "OpenIDでログイン" ではない通常の "ログイン" からパスワードの再発行を行うと、とりあえずログイン可能のようです

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

終了

SPARQLthon グループ

  • Virtuoso 7.2.5.1をインストール (千葉)
    • とりあえず taxonomy.ttl をロードしてみた: 14.3 M triples/min (並列化なし)
  • BioSample とかで DB 間のリンクを表すオントロジー(プロパティ)がほしい (大田)
  • TogoGenome テキスト検索の見直し (片山・岡別府)
  • TogoVar 開発計画 (片山・川島)
  • BH18 ポスター等うちあわせ (永野・片山)
  • BH18 ビール醸造計画

今後の予定

参考リンク

参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 大田達郎 (DBCLS)
  • 山口敦子 (DBCLS)
  • 守屋勇樹 (DBCLS)
  • 山本泰智 (DBCLS)
  • 小野浩雅 (DBCLS)
  • 仲里猛留 (DBCLS)
  • 内藤雄樹 (DBCLS)
  • 永野朗夫(penqe)27日のみ
  • 岡別府陽子 (MSS)
  • 木下聖子(創価大)27日のみ
  • 三浦信明(野口研)
  • 千葉啓和(DBCLS)
  • 櫛田達矢(NBDC)28日
  • 藤原豊史 (DBCLS)
  • 平原麗夏(penqe)
  • 浅野由衣(penqe)
  • 山田一作(野口研究所)27日13時まで、28日16時まで
  • 佐藤大輔(Lifematics)27日午後から
  • 建石由佳(NBDC)28日のみ
  • 藤澤貴智(遺伝研)
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