SPARQLthon71

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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
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**total glycomeデータベースへの新規データの登録(ヒトとマウス血清の比較グライコーム).(三浦) https://totalglycome.glycosmos.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
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* TODO http://sparqlthon.org に TODO 管理アプリを設置する(片山)
* TODO http://sparqlthon.org に TODO 管理アプリを設置する(片山)
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* [http://sparql-support.dbcls.jp/sparql-support_j.html SPARQL support] 更新(守屋)
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**  '[  ]' 内のインデント修正(CodeMirror の sparql mode の仕様)
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** フォント変更機能追加(日本語環境の macOS 上の Chrome のデフォルト等幅フォントが 'Osaka' で等幅じゃないので)
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* DBCLSサービスを引用している論文を収集するツールの活用(イエレナ、小野、大石)
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** ツールを使用し、 NBDCとTPPサービスを引用している論文の検索を実際に行った。
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* IOBC (Interlinking Ontology for Biological Cocepts)の整備(櫛田、古崎)
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** [http://kanaya.naist.jp/BiologicalActivity/NA_dictionary.pdf KNApSAcK Biological Activity]用語とのマッピング、追加(方法検討)
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** isA関係の整理(方法検討)
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* [https://github.com/genomegraph/vg_reverse_lookup 逆引きvgコマンド](大和田、横山、川島)
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* 新着論文レビュー係り受けコーパス(建石)
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** 形態素(区切り、品詞)修正の悩ましい例に関する検討と公開分の修正
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* IOBCのラベルを英和辞書として利用することの検討(藤原、櫛田、(建石))
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* TogoJiten(仮)のクエリ書きを分担するための準備(畠中)
=== 今後の予定 ===
=== 今後の予定 ===
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* 片山俊明 (DBCLS)
* 片山俊明 (DBCLS)
* 川島秀一 (DBCLS)
* 川島秀一 (DBCLS)
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* 大田達郎 (DBCLS)
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* 大田達郎 (DBCLS) 初日のみ😥
* 吉沢明康(京都大学)
* 吉沢明康(京都大学)
* 坊農秀雅 (DBCLS)
* 坊農秀雅 (DBCLS)
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* 佐藤大輔(Lifematics)
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* 佐藤大輔(Lifematics)23日のみ
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* 三浦信明(野口研)(23日は16時半頃引き上げ)
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* 岡別府(MSS)
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* 永野朗夫(penqe)初日のみ
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* 森宙史(遺伝研)24日のみ
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* 平原麗夏(penqe)初日のみ
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* 守屋勇樹 (DBCLS)
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* 田中聡 (Trans-IT)
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* 西出浩世(基生研)
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* 櫛田達矢(NBDC)23日午後から、24日
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* 古崎晃司(大阪大学)24日のみ
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* 鎌田真由美(京都大学)
 +
* 多湖真一郎(富士通研)
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* 山本泰智(DBCLS)23日午後
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* 内藤雄樹 (DBCLS) 23日のみ
 +
* 藤原豊史 (DBCLS)
 +
* 藤澤貴智(遺伝研)
 +
* 山口敦子 (DBCLS)
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* 建石由佳(NBDC)23日全日、24日午後
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* 畠中秀樹 (NBDC) 24日のみ
 +
* ソロビヨワ イエレナ(NBDC)24日
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* 大石直哉(DOGRUN)
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* 山中遼太 (Oracle)
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* 大和田周甫(東工大)

2018年8月24日 (金) 08:28時点における最新版

第71回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

プロジェクト

TPP グループ全体

継続中

終了

SPARQLthon グループ

  • TODO http://sparqlthon.org に TODO 管理アプリを設置する(片山)
  • SPARQL support 更新(守屋)
    • '[ ]' 内のインデント修正(CodeMirror の sparql mode の仕様)
    • フォント変更機能追加(日本語環境の macOS 上の Chrome のデフォルト等幅フォントが 'Osaka' で等幅じゃないので)
  • DBCLSサービスを引用している論文を収集するツールの活用(イエレナ、小野、大石)
    • ツールを使用し、 NBDCとTPPサービスを引用している論文の検索を実際に行った。
  • IOBC (Interlinking Ontology for Biological Cocepts)の整備(櫛田、古崎)
  • 逆引きvgコマンド(大和田、横山、川島)
  • 新着論文レビュー係り受けコーパス(建石)
    • 形態素(区切り、品詞)修正の悩ましい例に関する検討と公開分の修正
  • IOBCのラベルを英和辞書として利用することの検討(藤原、櫛田、(建石))
  • TogoJiten(仮)のクエリ書きを分担するための準備(畠中)

今後の予定

参考リンク

参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 大田達郎 (DBCLS) 初日のみ😥
  • 吉沢明康(京都大学)
  • 坊農秀雅 (DBCLS)
  • 佐藤大輔(Lifematics)23日のみ
  • 三浦信明(野口研)(23日は16時半頃引き上げ)
  • 岡別府(MSS)
  • 永野朗夫(penqe)初日のみ
  • 森宙史(遺伝研)24日のみ
  • 平原麗夏(penqe)初日のみ
  • 守屋勇樹 (DBCLS)
  • 田中聡 (Trans-IT)
  • 西出浩世(基生研)
  • 櫛田達矢(NBDC)23日午後から、24日
  • 古崎晃司(大阪大学)24日のみ
  • 鎌田真由美(京都大学)
  • 多湖真一郎(富士通研)
  • 山本泰智(DBCLS)23日午後
  • 内藤雄樹 (DBCLS) 23日のみ
  • 藤原豊史 (DBCLS)
  • 藤澤貴智(遺伝研)
  • 山口敦子 (DBCLS)
  • 建石由佳(NBDC)23日全日、24日午後
  • 畠中秀樹 (NBDC) 24日のみ
  • ソロビヨワ イエレナ(NBDC)24日
  • 大石直哉(DOGRUN)
  • 山中遼太 (Oracle)
  • 大和田周甫(東工大)
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