SPARQLthon65/ClinVar JSON-LD

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最新版 ClinVar の XML から JSON-LD を作れないか検討

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/clinvar/xml/clinvar_variation/beta/

  • variation_archive_20180125.xsd
  • variation_archive_20180125.xml.gz

XSD と ClinVar オントロジーの対応を検証

XML から JSON へ

require 'active_support'
require 'active_support/core_ext'

json = Hash.from_xml(ARGF.read).to_json
puts JSON.pretty_generate(JSON.parse(json))
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