SPARQLthon62

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=== TPP グループ全体 ===
=== TPP グループ全体 ===
==== H29〜 ====
==== H29〜 ====
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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp/
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* [https://research-er.jp/projects/view/965239 データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発] (黒川) - http://microbedb.jp
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** ポータルサイト構築
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** [[MicrobeDB.jpポータル開発#SPARQLthon62 ]]
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/TPP2-kinoshita 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
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** [[糖鎖情報のRDF連携について|糖鎖情報のRDF連携について]](新町)
 
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* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
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* [https://research-er.jp/projects/view/965235 エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充] (沖) - http://chip-atlas.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965235 エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充] (沖) - http://chip-atlas.org/
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** [[TPP-oki|TPP-oki]] (おおた)
 
* [https://research-er.jp/projects/view/965236 ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース] (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
* [https://research-er.jp/projects/view/965236 ゲノム・疾患・医薬品のネットワークデータベース] (金久) - http://www.kegg.jp/kegg/medicus/
==== 継続中(〜H30) ====
==== 継続中(〜H30) ====
* [[TPP-ishihama|プロテオーム統合データベース:jPOST]] (石濱) - http://jpostdb.org/
* [[TPP-ishihama|プロテオーム統合データベース:jPOST]] (石濱) - http://jpostdb.org/
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** データベース開発(守屋、田中)
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*** http://db-dev.jpostdb.org/db-copy/
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*** 主にバグ取り
* [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪)
* [[TPP-onami|生命動態システム科学のデータベースの統合化]] (大浪)
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=== SPARQLthon グループ ===
=== SPARQLthon グループ ===
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* トリプルストアおよび代替案検討:Virtuoso8, Stardog (推論) Neo4j, Oracle PGX (ネットワーク解析) (千葉)
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* DDBJ RDFのRDFポータル査定対応 → [[SPARQLthon62/DDBJ]] (藤澤、片山)
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* 複数gene間のGO比較 [[SPARQLthon/go_comparison]] (岡別府)
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* グラフゲノム構築パイプライン: [https://docbase.io/posts/300364/sharing/108ce773-f90c-4d8e-8ae7-ad0456105fe6 GGFフォーマットの提案](原薗、横山)
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* NBDCのRDFストア群を事典風に見せるためにacetaminophenページのモック作成 (畠中)
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* TogoVar関連(三橋、川嶋、豊岡、片山、川島)
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* 新着論文レビュー機能拡張の詳細検討(小野・山本・飯田・大石・建石)
=== 今後の予定 ===
=== 今後の予定 ===
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* RDF化ガイドライン最新版 → [[RDFizingDatabaseGuideline]]
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* RDF化ガイドライン最新版 → [https://github.com/dbcls/rdfizing-db-guidelines RDFizingDatabaseGuideline@GitHub] (スミマセン、最新版といいながら前回まで古いWikiへのリンクになっていました)
== 参考リンク ==
== 参考リンク ==
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* 川島秀一 (DBCLS)
* 川島秀一 (DBCLS)
* 坊農秀雅 (DBCLS) (11/9のみ)
* 坊農秀雅 (DBCLS) (11/9のみ)
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* 大田達郎 (DBCLS) 11/9のみ, ちょっと遅れます
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* 守屋勇樹 (DBCLS)
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* 岡別府陽子(MSS)
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* 建石由佳(NBDC)11/9午後、11/10
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* 永野朗夫(penqe)11/9 14:30〜、11/10
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* 千葉啓和(DBCLS)
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* 横山稔之(東大)11/10
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* 原薗陛正(東大)11/10
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* 三橋信孝(NBDC)11/9午後
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* 川嶋実苗(NBDC)11/9午後
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* 豊岡理人(NBDC)11/9午後
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* 大石直哉(DOGRUN)
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* 内藤雄樹(DBCLS)11/10のみ
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* 仲里猛留(DBCLS)
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* 西出浩世(基生研)
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* 田中聡 (Trans-IT) 11/9のみ
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* 藤原豊史(DBCLS)
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* 藤澤貴智(遺伝研)
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* 信定知江(NBDC)11/10 16時まで
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* 畠中秀樹 (NBDC) 11/10

2017年11月10日 (金) 09:04時点における最新版

第62回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

プロジェクト

TPP グループ全体

H29〜

継続中(〜H30)

〜H29

SPARQLthon グループ

  • トリプルストアおよび代替案検討:Virtuoso8, Stardog (推論) Neo4j, Oracle PGX (ネットワーク解析) (千葉)
  • DDBJ RDFのRDFポータル査定対応 → SPARQLthon62/DDBJ (藤澤、片山)
  • 複数gene間のGO比較 SPARQLthon/go_comparison (岡別府)
  • グラフゲノム構築パイプライン: GGFフォーマットの提案(原薗、横山)
  • NBDCのRDFストア群を事典風に見せるためにacetaminophenページのモック作成 (畠中)
  • TogoVar関連(三橋、川嶋、豊岡、片山、川島)
  • 新着論文レビュー機能拡張の詳細検討(小野・山本・飯田・大石・建石)

今後の予定

  • RDF化ガイドライン最新版 → RDFizingDatabaseGuideline@GitHub (スミマセン、最新版といいながら前回まで古いWikiへのリンクになっていました)

参考リンク

参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 坊農秀雅 (DBCLS) (11/9のみ)
  • 大田達郎 (DBCLS) 11/9のみ, ちょっと遅れます
  • 守屋勇樹 (DBCLS)
  • 岡別府陽子(MSS)
  • 建石由佳(NBDC)11/9午後、11/10
  • 永野朗夫(penqe)11/9 14:30〜、11/10
  • 千葉啓和(DBCLS)
  • 横山稔之(東大)11/10
  • 原薗陛正(東大)11/10
  • 三橋信孝(NBDC)11/9午後
  • 川嶋実苗(NBDC)11/9午後
  • 豊岡理人(NBDC)11/9午後
  • 大石直哉(DOGRUN)
  • 内藤雄樹(DBCLS)11/10のみ
  • 仲里猛留(DBCLS)
  • 西出浩世(基生研)
  • 田中聡 (Trans-IT) 11/9のみ
  • 藤原豊史(DBCLS)
  • 藤澤貴智(遺伝研)
  • 信定知江(NBDC)11/10 16時まで
  • 畠中秀樹 (NBDC) 11/10
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