SPARQLthon57

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** MicrobeDB.jpで用いている各Stanzaの日本語および英語Helpを記述中 (森, 千葉, 岡別府)
** MicrobeDB.jpで用いている各Stanzaの日本語および英語Helpを記述中 (森, 千葉, 岡別府)
* [https://research-er.jp/projects/view/965237 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
* [https://research-er.jp/projects/view/965237 糖鎖科学ポータルの構築] (木下)
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** [http://jcggdb.jp/rdf/ purl.jp/bio/12] 管理の変更検討(山田・櫛田)
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965238 蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化] (栗栖) - http://pdbj.org/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/
* [https://research-er.jp/projects/view/965241 個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築] (田畑) - http://pgdbj.jp/

2017年6月23日 (金) 05:15時点における版

第57回 SPARQLthon を下記日程で開催したいと思います。

目次

開催概要

プロジェクト

TPP グループ全体

H29〜

継続中(〜H30)

〜H29


SPARQLthon グループ

  • がんゲノム(山中)
    • ICGC Release 25 のデータ変換フロー作成に着手(Docker 利用、R2RML による変換、FALDO 使用)7/28 完了を目指す
  • 症例報告からの疾患と表現型の関連データ - AMED小崎班/PubCases (桝屋・荻島・藤原・山本・片山)
    • HPO日本語版の検証中(山本)
  • CT と電顕画像の撮影対象などの検討、メタデータ(桝屋・田村・久米)
  • 微生物の採取地のマッピングデータ、MEOへの追加項目などを森さんと摺り合わせ(高月)
  • 理研メタデータベース(桝屋・高月・レンツ)
  • AMED遺伝子変異の臨床解釈の自動化に寄与する知識ベースのRDF整備(鎌田・中津井・小島・多胡・柴田・高橋・安部)
  • Disease Compass の論文が出ました(古崎)
  • バクテリアのリファレンスグラフゲノムの作成(大和田・片山)
  • 糖鎖関連遺伝子のRDF化(山田)
    • ゲノムデータベースから人力で抽出した糖鎖関連の遺伝子リストのRDF化。ヒト、マウス、ラットを作成予定

今後の予定

参考リンク


参加者

  • 片山俊明 (DBCLS)
  • 川島秀一 (DBCLS)
  • 坊農秀雅 (DBCLS)
  • 守屋勇樹 (DBCLS)
  • 仲里猛留 (DBCLS)
  • 岡別府陽子 (MSS)
  • 古崎晃司 (大阪大学)
  • 桝屋啓志 (理研BRC)22日のみ
  • 久米慧嗣 (理研CLST)
  • 永野朗夫(penqe)
  • 山口敦子 (DBCLS)
  • 小林紀郎 (RIKEN 22日の夕方から参加)
  • 山田一作(野口研究所)22日午後から
  • 大和田周甫(東工大)22日のみ
  • 千葉啓和(DBCLS)
  • 高月照江(理研BRC)22日のみ
  • 五斗進(DBCLS)
  • 多湖真一郎(富士通研)
  • 高橋秀和(富士通研)
  • 中津井雅彦(京都大学)22日のみ
  • 小島諒介(京都大学) 22日のみ
  • 鎌田真由美(京都大学)22日のみ
  • 田村勝(理研BRC)22日午前のみ
  • 藤原豊史(DBCLS)
  • 内藤雄樹 (DBCLS)
  • 森宙史(遺伝研)23日は昼前まで
  • 大田達郎 (DBCLS) 金曜は昼から
  • 川嶋実苗 (NBDC) 23日午前
  • 宮崎和典 (NBDC) 23日午前
  • 三橋信孝 (NBDC) 23日午前
  • 柴田紘孝(富士通総研)22日のみ
  • 小野浩雅 (DBCLS)
  • 山本泰智 (DBCLS)
  • 阿部勝己(富士通)22日午後
  • 戀津魁(理研)22日のみ
  • Andrea Ghelfi(かずさ)
  • 田中聡 (Trans-IT) 22日のみ
  • 畠中秀樹 (NBDC) 23日のみ
  • 大石直哉(DOGRUN)
  • 信定知江 (NBDC) 23日のみ
  • 山中遼太(Oracle)22日のみ
  • 櫛田達矢(NBDC)23日
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