SPARQLthon24/DDBJ

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(Taxonomy OWL)
(DDBJ OWL)
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  > @prefix dcterms: <http://purl.org/dc/terms/> .
  > @prefix dcterms: <http://purl.org/dc/terms/> .
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* Ontology headerの変更
* Ontology headerの変更
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  >    dcterms:license <http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/> ;
  >    dcterms:license <http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/> ;
  >    owl:versionInfo "Version 10.3 October 2013" .
  >    owl:versionInfo "Version 10.3 October 2013" .
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* Version 10.3 October 2013 ルールの更新
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** 新設、廃止されたfeature/qualiferの表現について
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* <Feature Class> rdfs:seeAlso  SO_XXXXXXX 追加する
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** ft_so.jsonから取得、差し込む

2014年9月25日 (木) 07:19時点における版

Taxonomy OWL

  • owl:versionInfoのオブジェクトはtaxdump ファイルのタイムスタンプなどデータソースのバージョンにするか?
    • taxdumpは一日複数回更新される場合がある。owlへの変換は毎日AM4時に変換、AM6時にインポート。

DDBJ OWL

  • prefixの変更
1c1
< @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
---
> @base <http://ddbj.nig.ac.jp/ontologies/nucleotide/> .
3d2
< @prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
5c4,5
< @prefix xml: <http://www.w3.org/XML/1998/namespace> .
---
> @prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
> @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
6a7
> @prefix dcterms: <http://purl.org/dc/terms/> .
8c9
  • Ontology headerの変更
10,11c11,15
<     rdfs:label "insdc" ;
<     rdfs:seeAlso <http://www.insdc.org/> .
---
>     rdfs:label "DDBJ annotated nucleotide sequence ontology" ;
>     rdfs:comment "DDBJ annotated nucleotide sequence ontology for semantic representation of the INSDC (DDBJ/ENA/GenBank) sequence records" ;
>     rdfs:seeAlso <http://www.insdc.org/documents/feature-table> ;
>     dcterms:license <http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/> ;
>     owl:versionInfo "Version 10.3 October 2013" .
  • Version 10.3 October 2013 ルールの更新
    • 新設、廃止されたfeature/qualiferの表現について
  • <Feature Class> rdfs:seeAlso SO_XXXXXXX 追加する
    • ft_so.jsonから取得、差し込む
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