Galaxy ツールを作る

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[http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/DevConf2010 galaxy / galaxy-central / wiki / DevConf2010 – Bitbucket] でのトーク [http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/DevConf2010/galaxy_devconf_2010_scalable.pdf Building Scalable Galaxy] - Nate Coraor と [http://www.slideshare.net/nakao/galaxy-developer-conference-2010-report Galaxy Developer Conference 2010 レポート] を参照。
[http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/DevConf2010 galaxy / galaxy-central / wiki / DevConf2010 – Bitbucket] でのトーク [http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/DevConf2010/galaxy_devconf_2010_scalable.pdf Building Scalable Galaxy] - Nate Coraor と [http://www.slideshare.net/nakao/galaxy-developer-conference-2010-report Galaxy Developer Conference 2010 レポート] を参照。
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* バックエンドDBの選択:デフォルトはsqlite3、PostgreSQLやMySQLに変更すると性能アップ。
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* ファイルアップロード/ダウンロード時のI/Oブロックを回避する為のプロキシ設定。
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* マシンのコア数にあわせたスレッドモデル。

2010年10月20日 (水) 05:25時点における版

Galaxy グループログ

  • メンバー
    • 神沼さん
    • 神田 (こうだ、トピックリーダー)
    • 中尾
    • 山口
  • 興味のあるトピック
    • 具体的にどう使ってるのか?
      • 外部にだしてるのは少なくて、ローカルで使うパターンばかりだから調べても出て来ないかな
    • セキュリティはどうすれば?
      • ヒトデータをアップロード可能かな? (これは倫理関係だからここではパスかな)
      • ユーザーごとに分離されてるか?
    • ユーザーごとにツールの表示をカスタマイズ出来るか?
      • デフォルトだと全部表示されて、ユーザーには多すぎる
    • ソフトウェアを同梱して配布可能なのか調べたい

こうかな?

スケーラブル設定

galaxy / galaxy-central / wiki / DevConf2010 – Bitbucket でのトーク Building Scalable Galaxy - Nate Coraor と Galaxy Developer Conference 2010 レポート を参照。

  • バックエンドDBの選択:デフォルトはsqlite3、PostgreSQLやMySQLに変更すると性能アップ。
  • ファイルアップロード/ダウンロード時のI/Oブロックを回避する為のプロキシ設定。
  • マシンのコア数にあわせたスレッドモデル。
個人用ツール