BH16.12/MachineLearning

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(機械学習)
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* SVM
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* Deep Learning
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== 参考 ==
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* Robert's implementation: https://github.com/bio-ontology-research-group/walking-rdf-and-owl

2016年12月12日 (月) 07:21時点における版

目次

特徴ベクトル

  • JSTシソーラスのRDFから特徴ベクトルを作成
    • ランダムウォークでタームごとの URI 周辺のグラフパターンを学習
    • ターム毎に特徴ベクトルを生成
  • 遺伝子アノテーションの特徴ベクトルを生成
    • UniProtやTogoGenomeのエントリからMeSHを含むリンクを抽出
    • MeSHとJSTのタームの対応を学習

データセット

これにMeSHのRDFを加える? https://id.nlm.nih.gov/mesh/

  • 遺伝子アノテーション
    • TogoGenome
    • DDBJ
    • PDBj

機械学習

参考

個人用ツール