BH16.12/MachineLearning
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2016年12月12日 (月) 06:22時点における版
特徴ベクトル
- JSTシソーラスのRDFから特徴ベクトルを作成
- ランダムウォークでタームごとの URI 周辺のグラフパターンを学習
- ターム毎に特徴ベクトルを生成
- 遺伝子アノテーションの特徴ベクトルを生成
- UniProtやTogoGenomeのエントリからMeSHを含むリンクを抽出
- MeSHとJSTのタームの対応を学習
データセット
- JSTシソーラス
- https://stirdf.jglobal.jst.go.jp/page/lodchallenge_2016.html から利用申請
- 使いたいトリプル
- rdfs:seeAlso
- dct:subject
- skos:related
- skos:broader
- skos:narrower
これにMeSHのRDFを加える？ https://id.nlm.nih.gov/mesh/
- 遺伝子アノテーション
- TogoGenome
- DDBJ
- PDBj
機械学習
- TensorFlow
- SVM
- Deep Learning
