BH14.14/compound
提供:TogoWiki
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(→天然物の化学情報等のRDF化) |
(→KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化) |
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*** ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か | *** ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か | ||
- | ==KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化== | + | ==KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化(福島、西田)== |
+ | * Plant secondary metabolism の Wikipathways RDF化 | ||
+ | ** 何故Wikipathways RDFか | ||
+ | *** Visualizationのためのpathway layoutをsupportしたRDFであるため | ||
+ | ***Userが改変可能なpathway RDF(KEGG PATHWAYはこれを想定していない) | ||
+ | *** RIKENのin house databaseのIDとlinkさせる(問題無ければ) | ||
+ | ** 参考link | ||
+ | *** http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?map01060 | ||
+ | *** http://www.wikipathways.org/index.php/Help:WikiPathways_RDF | ||
+ | * 上下記のprojectとも何らかの連係? | ||
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==NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備== | ==NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備== |
2015年2月3日 (火) 01:26時点における版
目次 |
化合物関連情報のRDF化
- メンバー: 櫻井、山田、時松、福島、西田、櫛田
- サテライト参加:小寺、木村、三橋、新町
精密質量MSのピークアノテーション
- 精密質量MSのピークアノテーションにおける、イオン化状態(アダクト)の判定アルゴリズムを完成させる(櫻井)
糖鎖構造のRDF化とSPARQL
- 糖鎖構造のRDF化(山田)
- WURCS to WURCS-RDF修正
- 糖鎖構造検索(山田)
- WURCS to SPARQL修正
- 糖鎖構造検索のための基本単糖の検討(山田)
天然物の化学情報等のRDF化
- 天然物(アルカロイド)骨格分類データベース
- RDF設計
- reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中(小寺)
- KEGG compound と KEGG drugの同一entryが知れるようにしてほしい(Remark fieldがSame as…となっているもの)
- ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か
- reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中(小寺)
KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化(福島、西田)
- Plant secondary metabolism の Wikipathways RDF化
- 何故Wikipathways RDFか
- Visualizationのためのpathway layoutをsupportしたRDFであるため
- Userが改変可能なpathway RDF(KEGG PATHWAYはこれを想定していない)
- RIKENのin house databaseのIDとlinkさせる(問題無ければ)
- 参考link
- 何故Wikipathways RDFか
- 上下記のprojectとも何らかの連係?