BH14.14/compound

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(糖鎖構造のRDF化とSPARQL)
(天然物の化学情報等のRDF化)
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==天然物の化学情報等のRDF化==
==天然物の化学情報等のRDF化==
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* 天然物(アルカロイド)骨格分類データベース
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* RDF設計
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** reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中(小寺)
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*** KEGG compound と KEGG drugの同一entryが知れるようにしてほしい(Remark fieldがSame as…となっているもの)
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*** ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か
==KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化==
==KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化==
==NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備==
==NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備==

2015年2月3日 (火) 01:23時点における版

目次

化合物関連情報のRDF化

  • メンバー: 櫻井、山田、時松、福島、西田、櫛田
  • サテライト参加:小寺、木村、三橋、新町

精密質量MSのピークアノテーション

  • 精密質量MSのピークアノテーションにおける、イオン化状態(アダクト)の判定アルゴリズムを完成させる(櫻井)

糖鎖構造のRDF化とSPARQL

  • 糖鎖構造のRDF化(山田)
    • WURCS to WURCS-RDF修正
  • 糖鎖構造検索(山田)
  • WURCS to SPARQL修正
  • 糖鎖構造検索のための基本単糖の検討(山田)

天然物の化学情報等のRDF化

  • 天然物(アルカロイド)骨格分類データベース
  • RDF設計
    • reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中(小寺)
      • KEGG compound と KEGG drugの同一entryが知れるようにしてほしい(Remark fieldがSame as…となっているもの)
      • ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か

KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化

NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備

個人用ツール