BH14.14/compound
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(→精密質量MSのピークアノテーション) |
(→糖鎖構造のRDF化とSPARQL) |
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* 精密質量MSのピークアノテーションにおける、イオン化状態（アダクト）の判定アルゴリズムを完成させる | * 精密質量MSのピークアノテーションにおける、イオン化状態（アダクト）の判定アルゴリズムを完成させる | ||
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* 糖鎖構造のRDF化（山田） | * 糖鎖構造のRDF化（山田） | ||
** WURCS to WURCS-RDF修正 | ** WURCS to WURCS-RDF修正 | ||
| - | * | + | * 糖鎖構造検索 |
| - | * WURCS to | + | ** 構造検索SPARQL作成（新町＠創価大） |
| + | ** WURCS to SPARQL修正（山田） | ||
* 糖鎖構造検索のための基本単糖の検討（山田） | * 糖鎖構造検索のための基本単糖の検討（山田） | ||
2015年2月3日 (火) 01:29時点における版
目次 |
化合物関連情報のRDF化
- メンバー: 櫻井、山田、時松、福島、西田、櫛田
- サテライト参加：小寺、木村、三橋、新町
精密質量MSのピークアノテーション（櫻井）
- 精密質量MSのピークアノテーションにおける、イオン化状態（アダクト）の判定アルゴリズムを完成させる
糖鎖構造のRDF化とSPARQL（山田、新町）
- 糖鎖構造のRDF化（山田）
- WURCS to WURCS-RDF修正
- 糖鎖構造検索
- 構造検索SPARQL作成（新町＠創価大）
- WURCS to SPARQL修正（山田）
- 糖鎖構造検索のための基本単糖の検討（山田）
天然物の化学情報等のRDF化
- 天然物（アルカロイド）骨格分類データベース
- RDF設計
- reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中（小寺）
- KEGG compound と KEGG drugの同一entryが知れるようにしてほしい(Remark fieldがSame as…となっているもの)
- ChEBI ontologyとcompoundのlinkができるような何か
- reaction ontology PIERO 水面下でアップデート中（小寺）
KEGG PATHWAYがsupportしない(KGMLを提供していない)pathwayのRDF化(福島、西田)
- Plant secondary metabolism の Wikipathways RDF化
- 何故Wikipathways RDFか
- Visualizationのためのpathway layoutをsupportしたRDFであるため
- Userが改変可能なpathway RDF(KEGG PATHWAYはこれを想定していない)
- RIKENのin house databaseのIDとlinkさせる(問題無ければ)
- 参考link
- 何故Wikipathways RDFか
- 上下記のprojectとも何らかの連係?
NBDC版日化辞RDFデータの作成と提供準備（木村（JST, 東京で参加）、櫛田）
- NBDC版日化辞RDFデータの作成（J-Global版RDFデータの修正、追加）
- SIO, CHEMINFを使ったInChI, InChIKey情報のRDFデータ作成
- molファイル、構造画像データの追加
- ChemSpider等のリンク情報の追加
- トリプルストアの準備（三橋（東京で参加））
