BH14.14/Docker

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(本日のDockerfile: hmmemitのアノテーション追加)
(Day 3 追加)
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* https://registry.hub.docker.com/u/inutano/delve
* https://registry.hub.docker.com/u/inutano/delve
** FANTOM5で使われたshort read aligner
** FANTOM5で使われたshort read aligner
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== Day 3 ==
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Dockerthonをしてます。
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=== 本日のDockerfile ===
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* https://registry.hub.docker.com/u/bonohu/debian-hmmsearch2/
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** 昨日作成したhmmsearchのDockerfileでprofile HMMとDBを指定して実行できるように

2015年2月4日 (水) 01:38時点における版

Docker for BioDevOps, またの名を「チームなんでもコンテナ隊」

目次

Motivation

This is why we do this.

Members

  • 池田
  • 大石
  • 坊農
  • 仲里
  • 内藤
  • 小野
  • 大田

Manifesto

1日1コンテナ

バイオハッカソンでやりまぁす

  • 創薬系キュレーション支援ツールの環境配布 (池田)
  • ゲノム解析ワークフローのパッケージング・レシピ化
    • ゲノムアセンブラなど
    • Pitagora-Galaxy
    • FANTOM5データ解析ワークフローのパッケージング
  • ワイワイメタデータ
    • 複数ソースのメタデータの管理を一括化
      • SRA
      • BioSample
      • BioProject
      • Proteome
  • DBCLS SRA
    • UI改修

Day 1

Docker講習会をしました。環境は Docker on CoreOS launched via vagrant/virtualbox on MacOS です。

本日のDockerfile

Day 2

Docker講習会をしながらDockerfileをがりがり作っています。

本日のDockerfile

Day 3

Dockerthonをしてます。

本日のDockerfile

個人用ツール